RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 REPS2Q8NFH8 660 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 GMCL1Q96IK5 515 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 KAT14Q9H8E8 782 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 MAP10Q9P2G4 905 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.68□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC69A6NI79 296 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 BTBD19C9JJ37 291 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 CNMDO75829 334 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 DDAH1O94760 285 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 RTN1Q16799 776 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 MTMR8Q96EF0 704 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 ARID3AQ99856 593 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 JMJD4Q9H9V9 463 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 GINM1Q9NU53 330 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 FRMPD3Q5JV73 1810 aa9.67□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 OPLAHO14841 1288 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 GPR37L1O60883 481 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 CYP2C8P10632 490 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 BMP3P12645 472 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 DDIT3P35638 169 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 VEGFBP49765 207 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 PKP1Q13835 747 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 NPY5RQ15761 445 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 GADL1Q6ZQY3 521 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 ATG4CQ96DT6 458 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 FEZ1Q99689 392 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 PTPDC1A2A3K4 754 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 UNCXA6NJT0 531 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM232C9JQI7 657 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 KLRF2D3W0D1 207 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 CXCL11O14625 94 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 WDR46O15213 610 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 NT5C2P49902 561 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 C1QTNF8P60827 252 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 FGD1P98174 961 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 GRM1Q13255 1194 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 CCL15Q16663 113 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC96Q2M329 555 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 ADGRF4Q8IZF3 695 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 DCAF4Q8WV16 495 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 HHIPL1Q96JK4 782 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 CAPNS2Q96L46 248 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 PIGSQ96S52 555 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 MAP3K14Q99558 947 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 BTBD7Q9P203 1132 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-211ENST00000561438 ERICH2A1L162 156 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 IFNAR1P17181 557 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 CTGFP29279 349 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 SLC1A4P43007 532 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 RCAN1P53805 252 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 VAC14Q08AM6 782 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 DDX11Q96FC9 970 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 CHAMP1Q96JM3 812 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 RIPK3Q9Y572 518 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 POM121CA8CG34 1229 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 C19orf81C9J6K1 198 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD3-211ENST00000561438 S1PR4O95977 384 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms