RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 BICDL2A1A5D9 508 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 CARNS1A5YM72 827 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 CBFA2T2O43439 604 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 FAM200BP0CF97 657 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 TBX4P57082 545 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ST5P78524 1137 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 HLFQ16534 295 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 MORC1Q86VD1 984 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 IL17REQ8NFR9 667 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 PBX4Q9BYU1 374 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 SPEF2Q9C093 1822 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 UBN2Q6ZU65 1347 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 H3BRJ5 948 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 CELF2O95319 508 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ADMP35318 185 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 AOC3Q16853 763 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF790Q6PG37 636 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 PAOXQ6QHF9 649 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 SYNE4Q8N205 404 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 USP16Q9Y5T5 823 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 SCINQ9Y6U3 715 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 NPR1P16066 1061 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 WEE1P30291 646 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 MAN1A1P33908 653 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 PEX19P40855 299 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 PTK7Q13308 1070 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 DCTN1Q14203 1278 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 RPAINQ86UA6 219 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 KSR1Q8IVT5 923 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 GPC2Q8N158 579 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 SETDB2Q96T68 719 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ADAM19Q9H013 955 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 RAI14Q9P0K7 980 aa6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 PSME4Q14997 1843 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 MEGF11A6BM72 1044 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ADM5C9JUS6 153 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 BIN1O00499 593 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 STARD3NLO95772 234 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 GPTP24298 496 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 COX20Q5RI15 118 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC174Q6PII3 467 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 MCM10Q7L590 875 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 WNT8BQ93098 351 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 SPC25Q9HBM1 224 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TMOD3-209ENST00000561136 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa6.65□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 SZT2Q5T011 3432 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 A0A087WZG4 1122 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 FAM170BA6NMN3 283 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 PRC1O43663 620 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 CD53P19397 219 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 USP11P51784 963 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 PLCL1Q15111 1095 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 CRY2Q49AN0 593 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TMOD3-209ENST00000561136 SOGA3Q5TF21 947 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms