RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-207ENST00000558936 ADCYAP1R1P41586 468 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 HSD17B4P51659 736 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 APOBRQ0VD83 1088 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 LRRC41Q15345 812 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 CASC1Q6TDU7 716 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 RNF207Q6ZRF8 634 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 Q6ZUG5 572 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 FBXO11Q86XK2 927 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 HOMER1Q86YM7 354 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 FANCBQ8NB91 859 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 IL31RAQ8NI17 732 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTA-207ENST00000558936 SZT2Q5T011 3432 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 RGS20O76081 388 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 ARIH2O95376 493 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 SMPD1P17405 629 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 EVCP57679 992 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 NTRK3Q16288 839 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 RNF20Q5VTR2 975 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 MICU3Q86XE3 530 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 CEP290O15078 2479 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 ABCB11O95342 1321 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 ERICH2A1L162 156 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 MEIS2O14770 477 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 SMARCA1P28370 1054 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 NKX3-2P78367 333 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 KIF2CQ99661 725 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 AMNQ9BXJ7 453 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 NID2Q14112 1375 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 CCDC69A6NI79 296 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 H0YGN5 161 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 PPFIA3O75145 1194 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 REC8O95072 547 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 TMTC2Q8N394 836 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 COPS5Q92905 334 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 BRF1Q92994 677 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 PRO3102Q9H379 93 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 GRIN2DO15399 1336 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 LTBP2Q14767 1821 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 DNM1LO00429 736 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 MSCO60682 206 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 AKR1A1P14550 325 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 KRT32Q14532 448 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 PKN1Q16512 942 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 RUFY3Q7L099 469 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 EDIL3O43854 480 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 CFBP00751 764 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 GJA9P57773 515 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 BEX3Q00994 111 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 SNX17Q15036 470 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 FERMT2Q96AC1 680 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTA-207ENST00000558936 PXMP2Q9NR77 195 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms