RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.53■■□□□ 1.36
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MFGE8-208ENST00000558773 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.53■■□□□ 1.36
MFGE8-208ENST00000558773 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.53■■□□□ 1.36
MFGE8-208ENST00000558773 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.53■■□□□ 1.36
MFGE8-208ENST00000558773 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
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MFGE8-208ENST00000558773 IQCA1Q86XH1 822 aa23.52■■□□□ 1.36
MFGE8-208ENST00000558773 PNMA1Q8ND90 353 aa23.52■■□□□ 1.36
MFGE8-208ENST00000558773 RGS22Q8NE09 1264 aa23.52■■□□□ 1.36
MFGE8-208ENST00000558773 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.52■■□□□ 1.36
MFGE8-208ENST00000558773 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
MFGE8-208ENST00000558773 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.52■■□□□ 1.36
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MFGE8-208ENST00000558773 ZEB2O60315 1214 aa23.51■■□□□ 1.35
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MFGE8-208ENST00000558773 EDNRBP24530 442 aa23.5■■□□□ 1.35
MFGE8-208ENST00000558773 PDE4AP27815 886 aa23.5■■□□□ 1.35
MFGE8-208ENST00000558773 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
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MFGE8-208ENST00000558773 IL25Q9H293 177 aa23.5■■□□□ 1.35
MFGE8-208ENST00000558773 CPVLQ9H3G5 476 aa23.5■■□□□ 1.35
MFGE8-208ENST00000558773 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
MFGE8-208ENST00000558773 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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MFGE8-208ENST00000558773 TMEM199Q8N511 208 aa23.49■■□□□ 1.35
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MFGE8-208ENST00000558773 KAT14Q9H8E8 782 aa23.49■■□□□ 1.35
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MFGE8-208ENST00000558773 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.48■■□□□ 1.35
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MFGE8-208ENST00000558773 MYLIPQ8WY64 445 aa23.43■■□□□ 1.34
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MFGE8-208ENST00000558773 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.42■■□□□ 1.34
MFGE8-208ENST00000558773 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
MFGE8-208ENST00000558773 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
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MFGE8-208ENST00000558773 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.41■■□□□ 1.34
MFGE8-208ENST00000558773 HERVK_113Q902F9 699 aa23.41■■□□□ 1.34
MFGE8-208ENST00000558773 COPS5Q92905 334 aa23.41■■□□□ 1.34
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