RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555690.5

PPP4R4-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PPP4R4, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R4-204	ENST00000555690	NEDD4	P46934	1319 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PPP4R4-204	ENST00000555690	ACR	P10323	421 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PPP4R4-204	ENST00000555690	CALML3	P27482	149 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PPP4R4-204	ENST00000555690	NUCB1	Q02818	461 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PPP4R4-204	ENST00000555690	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PPP4R4-204	ENST00000555690	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4R4-204	ENST00000555690	SNHG28	P0DPA3	235 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4R4-204	ENST00000555690	CYP2C18	P33260	490 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4R4-204	ENST00000555690	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4R4-204	ENST00000555690	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PPP4R4-204	ENST00000555690	ESR2	Q92731	530 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4R4-204	ENST00000555690	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF213	O14771	459 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	DNAJB2	P25686	324 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	PSMC6	P62333	389 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF365	Q70YC5	407 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	PNMA2	Q9UL42	364 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	FOSL2	P15408	326 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	CPVL	Q9H3G5	476 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	HIPK3	Q9H422	1215 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	VCAN	P13611	3396 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	GRIN2C	Q14957	1233 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	RASIP1	Q5U651	963 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	DGKH	Q86XP1	1220 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	B4GALT4	O60513	344 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	KDM4A	O75164	1064 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	TIFA	Q96CG3	184 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	IL23A	Q9NPF7	189 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	PDE4D	Q08499	809 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	USH1G	Q495M9	461 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF576	Q9H609	170 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	PBX2	P40425	430 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCL23	P55773	120 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	IQCA1	Q86XH1	822 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	PNMA1	Q8ND90	353 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690	PBX4	Q9BYU1	374 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PPP4R4-204	ENST00000555690		B4E1Z4	1266 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	HIP1	O00291	1037 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	FGB	P02675	491 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	MYL3	P08590	195 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	EDNRB	P24530	442 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	CPT1A	P50416	773 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	DNER	Q8NFT8	737 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	HERVK_113	Q902F9	699 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	KAT14	Q9H8E8	782 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	NT5C2	P49902	561 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	PPP2R5B	Q15173	497 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	ANKS1A	Q92625	1134 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	RGS22	Q8NE09	1264 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	SCFD2	Q8WU76	684 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	COPS5	Q92905	334 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	TBC1D5	Q92609	795 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690		B4DLN1	442 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	28.58	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	SCLY	Q96I15	445 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PPP4R4-204	ENST00000555690	LAMA4	Q16363	1823 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PPP4R4-204	ENST00000555690	MYO9B	Q13459	2157 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PPP4R4-204	ENST00000555690	CYP2C9	P11712	490 aa		28.57	■■■□□ 2.16

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