RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 PRR13Q9NZ81 148 aa7.61□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 PPT2Q9UMR5 302 aa7.61□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.61□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 IMPDH2P12268 514 aa7.6□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 RTP2Q5QGT7 225 aa7.6□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 TEPSINQ96N21 525 aa7.6□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.6□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 CRBNQ96SW2 442 aa7.6□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 SLC9A7Q96T83 725 aa7.6□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.6□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.6□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 SNTG2Q9NY99 539 aa7.6□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 A0A1W2PQ27 194 aa7.59□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 A0A1W2PQ64 194 aa7.59□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 A0A1W2PQC6 194 aa7.59□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 A0A1W2PQD8 194 aa7.59□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 GSNP06396 782 aa7.59□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 NR1I3Q14994 352 aa7.59□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.59□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 NAT16Q8N8M0 369 aa7.59□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.59□□□□□ -1.19
USP15-218ENST00000552346 GSTM1P09488 218 aa7.58□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 MAPKAPK2P49137 400 aa7.58□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 KRTAP10-2P60368 255 aa7.58□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 MVKQ03426 396 aa7.58□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 C7orf61Q8IZ16 206 aa7.58□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.58□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 FERD3LQ96RJ6 166 aa7.58□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 IRS2Q9Y4H2 1338 aa7.57□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.57□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 FAM86C2PA6NEL3 165 aa7.57□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 PFKLP17858 780 aa7.57□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 LIMS1P48059 325 aa7.57□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 CASP7P55210 303 aa7.57□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 NFKB2Q00653 900 aa7.57□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa7.57□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.57□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 JAMLQ86YT9 394 aa7.57□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.57□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.57□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.57□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 FFAR3O14843 346 aa7.56□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 MSL3P1P0C860 447 aa7.56□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 CAP1Q01518 475 aa7.56□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.56□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.56□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 BRINP2Q9C0B6 783 aa7.56□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.56□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 C9IYK1 514 aa7.55□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 SHOXO15266 292 aa7.55□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 ADRB1P08588 477 aa7.55□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 KCNC1P48547 511 aa7.55□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 DDR2Q16832 855 aa7.55□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 A0A1W2PQJ5 194 aa7.54□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 H0Y8X5 98 aa7.54□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 DBHP09172 617 aa7.54□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 ACRP10323 421 aa7.54□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 SLURP1P55000 103 aa7.54□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 RASGRF1Q13972 1273 aa7.54□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.54□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.54□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 GGNQ86UU5 652 aa7.54□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 CYBBP04839 570 aa7.53□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 PLP2Q04941 152 aa7.53□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 FXNQ16595 210 aa7.53□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 PTPROQ16827 1216 aa7.53□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 BICRALQ6AI39 1079 aa7.53□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.53□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 LILRB2Q8N423 598 aa7.53□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 BORCS6Q96GS4 357 aa7.53□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 BDH2Q9BUT1 245 aa7.53□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 TMX1Q9H3N1 280 aa7.53□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.53□□□□□ -1.2
USP15-218ENST00000552346 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
USP15-218ENST00000552346 PDPK1O15530 556 aa7.52□□□□□ -1.21
USP15-218ENST00000552346 SRGAP3O43295 1099 aa7.52□□□□□ -1.21
USP15-218ENST00000552346 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
USP15-218ENST00000552346 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
USP15-218ENST00000552346 DCAF15Q66K64 600 aa7.52□□□□□ -1.21
USP15-218ENST00000552346 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
USP15-218ENST00000552346 DNAJC7Q99615 494 aa7.52□□□□□ -1.21
USP15-218ENST00000552346 PDLIM7Q9NR12 457 aa7.52□□□□□ -1.21
USP15-218ENST00000552346 SUSD2Q9UGT4 822 aa7.52□□□□□ -1.21
USP15-218ENST00000552346 FBLN1P23142 703 aa7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.5 ms