RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551124.5

IKZF4-211, Transcript of IKAROS family zinc finger 4, human

TSL 1 (best)

Gene IKZF4, Length 4,396 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IKZF4-211	ENST00000551124	DISC1	Q9NRI5	854 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	CEP104	O60308	925 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	PPP2R5C	Q13362	524 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	NLRP4	Q96MN2	994 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	MXRA7	P84157	204 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	CBX8	Q9HC52	389 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		10.63	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	SHROOM2	Q13796	1616 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	CRB1	P82279	1406 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	IGSF3	O75054	1194 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	GNA14	O95837	355 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	CCND2	P30279	289 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	DGKH	Q86XP1	1220 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	SP8	Q8IXZ3	490 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	C7orf31	Q8N865	590 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	MTMR6	Q9Y217	621 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	MICALL2	Q8IY33	904 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	FBXO40	Q9UH90	709 aa		10.62	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	BRD1	O95696	1058 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	IFNAR1	P17181	557 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	CMA1	P23946	247 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	ZNF445	P59923	1031 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	MTX1	Q13505	466 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	GBP6	Q6ZN66	633 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	PEX26	Q7Z412	305 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	TTC14	Q96N46	770 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	VGLL3	A8MV65	326 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	HOXD10	P28358	340 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	CLIC4	Q9Y696	253 aa		10.61	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	ZBBX	A8MT70	800 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124		F5H6K3	240 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	PSMC4	P43686	418 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	TRAPPC10	P48553	1259 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	KLRC3	Q07444	240 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	LRRC41	Q15345	812 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	DAAM2	Q86T65	1068 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	GPATCH11	Q8N954	259 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	RNF146	Q9NTX7	359 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		10.6	□□□□□ -0.71
IKZF4-211	ENST00000551124	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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