RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544805.1

RNF10-222, Transcript of ring finger protein 10, human

TSL 2

Gene RNF10, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF609	O15014	1411 aa		10.15	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805		A6NJY4	79 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ADORA1	P30542	326 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	KIF5B	P33176	963 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	PHKA1	P46020	1223 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SLMAP	Q14BN4	828 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	CCDC102B	Q68D86	513 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	RGMB	Q6NW40	437 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	CCDC80	Q76M96	950 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	FAM81B	Q96LP2	452 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SPAG5	Q96R06	1193 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	APBA2	Q99767	749 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	DNAJC6	O75061	913 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	PDGFRB	P09619	1106 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ENPP1	P22413	925 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	GJA8	P48165	433 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	FKBP1B	P68106	108 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	INF2	Q27J81	1249 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	MAML1	Q92585	1016 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	FEZ1	Q99689	392 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	MKS1	Q9NXB0	559 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	CPLX1	O14810	134 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	AOC2	O75106	756 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ERLIN1	O75477	346 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	USP46	P62068	366 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	NOG	Q13253	232 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	PDE3A	Q14432	1141 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ODR4	Q5SWX8	454 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	CEP85	Q6P2H3	762 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	APPL2	Q8NEU8	664 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SSH3	Q8TE77	659 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	NACC2	Q96BF6	587 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SLC39A13	Q96H72	371 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	FRMD6	Q96NE9	622 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805		A0A1B0GUL6	1792 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	FAM170A	A1A519	330 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ORC4	O43929	436 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	TCEA3	O75764	348 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	MYBL2	P10244	700 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	HOXC13	P31276	330 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	MAP2K2	P36507	400 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	GNAL	P38405	381 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	GSTO1	P78417	241 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SLC7A5	Q01650	507 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	ICA1	Q05084	483 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	DEUP1	Q05D60	604 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	PKN1	Q16512	942 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	TNNI3K	Q59H18	835 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RNF10-222	ENST00000544805	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79

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