RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 SNAP25P60880 206 aa21.91■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 ITGA7Q13683 1181 aa21.91■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 TMEM240Q5SV17 173 aa21.91■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 CXCL17Q6UXB2 119 aa21.91■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 PDGFCQ9NRA1 345 aa21.91■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 NCOR1O75376 2440 aa21.9■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 NEDD4P46934 1319 aa21.9■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 ZNF213O14771 459 aa21.9■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 IGHDP01880 384 aa21.9■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 HAND2P61296 217 aa21.9■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 BEX3Q00994 111 aa21.9■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 RILPL2Q969X0 211 aa21.9■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.9■■□□□ 1.1
LTBR-211ENST00000543190 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.89■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 IQCA1Q86XH1 822 aa21.89■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.89■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 GBF1Q92538 1859 aa21.89■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.89■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 CSF2RAP15509 400 aa21.88■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 DNAJB2P25686 324 aa21.88■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 RPS6P62753 249 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.88■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 HERVK_113Q902F9 699 aa21.88■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21.88■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 IL23AQ9NPF7 189 aa21.88■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 B4DLN1 442 aa21.87■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 CPT1AP50416 773 aa21.87■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 PNMA1Q8ND90 353 aa21.87■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 SCFD2Q8WU76 684 aa21.87■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 FAM161BQ96MY7 647 aa21.87■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.87■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.86■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 A6NJR5 290 aa21.86■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 KPNA6O60684 536 aa21.86■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 GHRHRQ02643 423 aa21.86■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.86■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.86■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.86■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.86■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 HIPK3Q9H422 1215 aa21.86■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.86■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.86■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 MTMR7Q9Y216 660 aa21.86■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 B4GALT4O60513 344 aa21.85■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 KDM4AO75164 1064 aa21.85■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.85■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.85■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.85■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.85■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 TRANK1O15050 2925 aa21.85■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.84■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 ZNF365Q70YC5 407 aa21.84■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 KRT23Q9C075 422 aa21.84■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.84■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 ABCB11O95342 1321 aa21.83■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 RAD50Q92878 1312 aa21.83■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 PFKMP08237 780 aa21.83■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 CYP2C18P33260 490 aa21.83■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 PDE4DQ08499 809 aa21.83■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.83■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.83■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 MYLIPQ8WY64 445 aa21.83■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.83■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 ZNF576Q9H609 170 aa21.83■■□□□ 1.09
LTBR-211ENST00000543190 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
LTBR-211ENST00000543190 CALML3P27482 149 aa21.82■■□□□ 1.08
LTBR-211ENST00000543190 PPP2R5BQ15173 497 aa21.82■■□□□ 1.08
LTBR-211ENST00000543190 CCDC62Q6P9F0 684 aa21.82■■□□□ 1.08
LTBR-211ENST00000543190 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.82■■□□□ 1.08
LTBR-211ENST00000543190 TIFAQ96CG3 184 aa21.82■■□□□ 1.08
LTBR-211ENST00000543190 VWCEQ96DN2 955 aa21.82■■□□□ 1.08
LTBR-211ENST00000543190 IWS1Q96ST2 819 aa21.82■■□□□ 1.08
LTBR-211ENST00000543190 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
LTBR-211ENST00000543190 PBX4Q9BYU1 374 aa21.82■■□□□ 1.08
LTBR-211ENST00000543190 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.82■■□□□ 1.08
LTBR-211ENST00000543190 KAT14Q9H8E8 782 aa21.82■■□□□ 1.08
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