RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	SCN9A	Q15858	1988 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ERICH2	A1L162	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	MCM7	P33993	719 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	VAV2	P52735	878 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	P2RX5	Q93086	422 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897		B4DLN1	442 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	FCER1A	P12319	257 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TTMP	Q5BVD1	217 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	MBOAT7	Q96N66	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GAK	O14976	1311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ENC1	O14682	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	N4BP3	O15049	544 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ZEB2	O60315	1214 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	USP17L8	P0C7I0	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PLCG1	P19174	1290 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CALML3	P27482	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RHBDL3	P58872	404 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	UBXN1	Q04323	297 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GABPA	Q06546	454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CD302	Q8IX05	232 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897		H0YGN5	161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RNF40	O75150	1001 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	XBP1	P17861	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	HSPA2	P54652	639 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PACS2	Q86VP3	889 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	IQCK	Q8N0W5	287 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GGCX	P38435	758 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	VPS18	Q9P253	973 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	MYMK	A6NI61	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	CES2	O00748	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	HOXD13	P35453	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	FNTA	P49354	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	NNT	Q13423	1086 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	PNMA1	Q8ND90	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTSC-208	ENST00000533897	HAS1	Q92839	578 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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