RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526095.1

KCNQ1-206, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 3

Gene KCNQ1, Length 1,046 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-206ENST00000526095 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa18.39■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF213O14771 459 aa18.39■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 TLR3O15455 904 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 GOLGA8HP0CJ92 632 aa18.39■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa18.39■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 C16orf59Q7L2K0 433 aa18.39■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 CPVLQ9H3G5 476 aa18.39■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 Q9Y3F1 56 aa18.39■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 WDR19Q8NEZ3 1342 aa18.39■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa18.39■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 KDM4AO75164 1064 aa18.38■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 CABYRO75952 493 aa18.38■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 CSF2RAP15509 400 aa18.38■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 CALML3P27482 149 aa18.38■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP18.38■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 ITGA7Q13683 1181 aa18.38■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa18.37■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 CYP2C18P33260 490 aa18.37■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 PSMC6P62333 389 aa18.37■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 DUSP28Q4G0W2 176 aa18.37■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 TMEM240Q5SV17 173 aa18.37■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 RNF207Q6ZRF8 634 aa18.37■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 DGKHQ86XP1 1220 aa18.37■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 MYLIPQ8WY64 445 aa18.37■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.37■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 UBA5Q9GZZ9 404 aa18.37■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 IL25Q9H293 177 aa18.37■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 SCN5AQ14524 2016 aa18.37■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 B4E1Z4 1266 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 HIP1O00291 1037 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 ZEB2O60315 1214 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 RPS6P62753 249 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 USH1GQ495M9 461 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 UMODL1Q5DID0 1318 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 TMEM199Q8N511 208 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 PNMA1Q8ND90 353 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 WDR11Q9BZH6 1224 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 PNMA2Q9UL42 364 aa18.36■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 TMEM265A0A087WTH1 108 aa18.35■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 B4GALT4O60513 344 aa18.35■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 ACRP10323 421 aa18.35■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 EDNRBP24530 442 aa18.35■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 DNAJB2P25686 324 aa18.35■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 RASIP1Q5U651 963 aa18.35■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 IQCA1Q86XH1 822 aa18.35■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 ANKS1AQ92625 1134 aa18.35■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 TRPV6Q9H1D0 765 aa18.35■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 PDE4AP27815 886 aa18.34■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 NT5C2P49902 561 aa18.34■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 PDE4DQ08499 809 aa18.34■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF365Q70YC5 407 aa18.34■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP18.34■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 HIPK3Q9H422 1215 aa18.34■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 KAT14Q9H8E8 782 aa18.34■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 ZSWIM5Q9P217 1185 aa18.34■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 TANC1Q9C0D5 1861 aa18.34■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 MYH7BA7E2Y1 1941 aa18.33■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 TNKSO95271 1327 aa18.33■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa18.33■□□□□ 0.53
KCNQ1-206ENST00000526095 PURAQ00577 322 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.33■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 ADGRF4Q8IZF3 695 aa18.33■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 DNERQ8NFT8 737 aa18.33■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 OR6J1Q8NGC5 347 aa18.33■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 IL23AQ9NPF7 189 aa18.33■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 GRXCR1A8MXD5 290 aa18.32■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 ASPRV1Q53RT3 343 aa18.32■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 TBC1D5Q92609 795 aa18.32■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 COPS5Q92905 334 aa18.32■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa18.32■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 WNT8AQ9H1J5 351 aa18.32■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 POLR3EQ9NVU0 708 aa18.32■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 ABCB11O95342 1321 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 MYL3P08590 195 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 FOSL2P15408 326 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 PBX2P40425 430 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 CPT1AP50416 773 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 CCL23P55773 120 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 GRIN2CQ14957 1233 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 PPP2R5BQ15173 497 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 QRICH1Q2TAL8 776 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 RGS22Q8NE09 1264 aa18.31■□□□□ 0.52
KCNQ1-206ENST00000526095 SCFD2Q8WU76 684 aa18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms