RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512343.5

RASGEF1B-209, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RASGEF1B, Length 498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-209ENST00000512343 CCL23P55773 120 aa25.9■■□□□ 1.74
RASGEF1B-209ENST00000512343 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.9■■□□□ 1.74
RASGEF1B-209ENST00000512343 USP38Q8NB14 1042 aa25.9■■□□□ 1.74
RASGEF1B-209ENST00000512343 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.9■■□□□ 1.74
RASGEF1B-209ENST00000512343 HIPK3Q9H422 1215 aa25.9■■□□□ 1.74
RASGEF1B-209ENST00000512343 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa25.89■■□□□ 1.74
RASGEF1B-209ENST00000512343 IL23AQ9NPF7 189 aa25.89■■□□□ 1.74
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZEB2O60315 1214 aa25.88■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 AKNAD1Q5T1N1 836 aa25.88■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 CPVLQ9H3G5 476 aa25.88■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 Q9Y3F1 56 aa25.88■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZMYM6O95789 1325 aa25.88■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 NEDD4P46934 1319 aa25.88■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 MYO9BQ13459 2157 aa25.88■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 GOLGA8HP0CJ92 632 aa25.87■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZNF543Q08ER8 600 aa25.87■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 DUSP28Q4G0W2 176 aa25.87■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.87■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa25.87■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.87■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 WNT8AQ9H1J5 351 aa25.87■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 RNF207Q6ZRF8 634 aa25.86■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.86■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 LAMA4Q16363 1823 aa25.86■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 FGBP02675 491 aa25.85■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 SDSP20132 328 aa25.85■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 HERVK_113Q902F9 699 aa25.85■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 SCLYQ96I15 445 aa25.85■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 PRDM12Q9H4Q4 367 aa25.85■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 SCN5AQ14524 2016 aa25.85■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 MYL3P08590 195 aa25.84■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 SNHG28P0DPA3 235 aa25.84■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 USH1GQ495M9 461 aa25.84■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 TTC14Q96N46 770 aa25.84■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.84■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 CYP2C9P11712 490 aa25.83■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 OR6J1Q8NGC5 347 aa25.83■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 PPM1EQ8WY54 764 aa25.83■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 COPS5Q92905 334 aa25.83■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 PRDM6Q9NQX0 595 aa25.83■■□□□ 1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 PURAQ00577 322 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 PDE4DQ08499 809 aa25.82■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.82■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 SMC5Q8IY18 1101 aa25.82■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 VWCEQ96DN2 955 aa25.82■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa25.82■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 MYH6P13533 1939 aa25.81■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 IGHDP01880 384 aa25.81■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 ESR2Q92731 530 aa25.81■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.81■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 WDR19Q8NEZ3 1342 aa25.81■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa25.8■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZNF213O14771 459 aa25.8■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 PCP11498 1178 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 RABGGTBP53611 331 aa25.8■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.8■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 TICAM2Q86XR7 235 aa25.8■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 TBC1D5Q92609 795 aa25.8■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 MSRAQ9UJ68 235 aa25.8■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 VCANP13611 3396 aa25.79■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.79■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 KDM4AO75164 1064 aa25.79■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 EDNRBP24530 442 aa25.79■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 CPT1AP50416 773 aa25.79■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 PPP2R5BQ15173 497 aa25.79■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa25.79■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 TNKSO95271 1327 aa25.79■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 B4E1Z4 1266 aa25.78■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 ARIH2O95376 493 aa25.78■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 MYOGP15173 224 aa25.78■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 ADGRE1Q14246 886 aa25.78■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 RAB30Q15771 203 aa25.78■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 NBPF20Q3BBV1 942 aa25.78■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 FAM47CQ5HY64 1035 aa25.78■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 PNMA1Q8ND90 353 aa25.78■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 ZBBXA8MT70 800 aa25.77■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 DEFB128Q7Z7B8 93 aa25.77■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 DGKHQ86XP1 1220 aa25.77■■□□□ 1.72
RASGEF1B-209ENST00000512343 SCFD2Q8WU76 684 aa25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms