RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.42□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 UNCXA6NJT0 531 aa7.41□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 PPM1BO75688 479 aa7.41□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 GLI4P10075 376 aa7.41□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 ATF2P15336 505 aa7.41□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.41□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.41□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.41□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.41□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.4□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 FFAR3O14843 346 aa7.4□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 PFKLP17858 780 aa7.4□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 MC3RP41968 323 aa7.4□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 KIAA1211LQ6NV74 962 aa7.4□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.4□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa7.4□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 RGS22Q8NE09 1264 aa7.4□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.4□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 BCAS3Q9H6U6 928 aa7.4□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.4□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.4□□□□□ -1.22
SSB-211ENST00000490914 SYN1P17600 705 aa7.39□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 SEPHS1P49903 392 aa7.39□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 CASP7P55210 303 aa7.39□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 AMPD2Q01433 879 aa7.39□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 CPLX3Q8WVH0 158 aa7.39□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.39□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 GULP1Q9UBP9 304 aa7.39□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.39□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 FOXO4P98177 505 aa7.38□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 GRB10Q13322 594 aa7.38□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 VHLLQ6RSH7 139 aa7.38□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 SP8Q8IXZ3 490 aa7.38□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa7.38□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.38□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 ASGR2P07307 311 aa7.37□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 VWA3BQ502W6 1294 aa7.37□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 LZTR1Q8N653 840 aa7.37□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.37□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 MTA3Q9BTC8 594 aa7.37□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.37□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 AKT3Q9Y243 479 aa7.37□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 A0A1B0GTL3 188 aa7.36□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.36□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 MBLAC2Q68D91 279 aa7.36□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 ALG3Q92685 438 aa7.36□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.36□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.36□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 LGR4Q9BXB1 951 aa7.36□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 C7orf72A4D263 438 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 KCNH1O95259 989 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 PAMP19021 973 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 PMLP29590 882 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 SLURP1P55000 103 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 HTRA3P83110 453 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 CAP1Q01518 475 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 CXorf38Q8TB03 319 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 RNF38Q9H0F5 515 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 CLEC1BQ9P126 229 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.35□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 NCAM1P13591 858 aa7.34□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 SCRN1Q12765 414 aa7.34□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 CABP7Q86V35 215 aa7.34□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.34□□□□□ -1.23
SSB-211ENST00000490914 PLS3P13797 630 aa7.33□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.33□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 NETO2Q8NC67 525 aa7.33□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 COPS5Q92905 334 aa7.33□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.33□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 NPHS1O60500 1241 aa7.32□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 FUCA1P04066 466 aa7.32□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 KCNC1P48547 511 aa7.32□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 CYP4F3Q08477 520 aa7.32□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.32□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 LIPIQ6XZB0 460 aa7.32□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.32□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.32□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 HOMEZQ8IX15 550 aa7.32□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 BVESQ8NE79 360 aa7.32□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 USP33Q8TEY7 942 aa7.32□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 DPF3Q92784 378 aa7.32□□□□□ -1.24
SSB-211ENST00000490914 PEX11GQ96HA9 241 aa7.32□□□□□ -1.24
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