RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.76□□□□□ -1.33
PTEN-204ENST00000487939 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.76□□□□□ -1.33
PTEN-204ENST00000487939 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
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PTEN-204ENST00000487939 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.75□□□□□ -1.33
PTEN-204ENST00000487939 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTEN-204ENST00000487939 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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PTEN-204ENST00000487939 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTEN-204ENST00000487939 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTEN-204ENST00000487939 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTEN-204ENST00000487939 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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PTEN-204ENST00000487939 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.74□□□□□ -1.33
PTEN-204ENST00000487939 USP35Q9P2H5 1018 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTEN-204ENST00000487939 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.74□□□□□ -1.33
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PTEN-204ENST00000487939 MYO1BO43795 1136 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTEN-204ENST00000487939 CDC6Q99741 560 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTEN-204ENST00000487939 LZTR1Q8N653 840 aa6.72□□□□□ -1.33
PTEN-204ENST00000487939 C1orf159Q96HA4 380 aa6.72□□□□□ -1.33
PTEN-204ENST00000487939 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTEN-204ENST00000487939 GTF2A2P52657 109 aa6.71□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 KIR3DS1Q14943 382 aa6.71□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 BICRALQ6AI39 1079 aa6.71□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.71□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 OSBP2Q969R2 916 aa6.71□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 GULP1Q9UBP9 304 aa6.71□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 SRGAP3O43295 1099 aa6.7□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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PTEN-204ENST00000487939 NR1I3Q14994 352 aa6.7□□□□□ -1.34
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PTEN-204ENST00000487939 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 USP53Q70EK8 1073 aa6.7□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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PTEN-204ENST00000487939 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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PTEN-204ENST00000487939 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.7□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 PEX10O60683 326 aa6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 CYBBP04839 570 aa6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 FAM153BP0C7A2 387 aa6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 TACR1P25103 407 aa6.69□□□□□ -1.34
PTEN-204ENST00000487939 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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