RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487873.1

C6orf136-211, Transcript of chromosome 6 open reading frame 136, humanhuman

TSL 3

Gene C6orf136, Length 464 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136-211ENST00000487873 TPCN1Q9ULQ1 816 aa16.08■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa16.08■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 GHRHRQ02643 423 aa16.07■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 CCL14Q16627 93 aa16.07■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 KIF2CQ99661 725 aa16.07■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 RPTORQ8N122 1335 aa16.07■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 ZNF236Q9UL36 1845 aa16.07■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 MSCO60682 206 aa16.06■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 CFBP00751 764 aa16.06■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 CCL5P13501 91 aa16.06■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 SCG2P13521 617 aa16.06■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 HSD17B4P51659 736 aa16.06■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 STK3Q13188 491 aa16.06■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa16.06■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 RNF208Q9H0X6 261 aa16.06■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 PSTPIP2Q9H939 334 aa16.06■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 CCDC85CA6NKD9 419 aa16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 DEXIO95424 95 aa16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 IGHA2P01877 340 aa16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 NAPAP54920 295 aa16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 CNTN2Q02246 1040 aa16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 NTRK3Q16288 839 aa16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 MCTP2Q6DN12 878 aa16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 SLC30A10Q6XR72 485 aa16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 CCDC148Q8NFR7 591 aa16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 WASF1Q92558 559 aa16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 IWS1Q96ST2 819 aa16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 SLC26A6Q9BXS9 759 aa16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 BARHL2Q9NY43 387 aa16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 FLRT1Q9NZU1 646 aa16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 MGAMO43451 1857 aa16.05■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 PIK3CDO00329 1044 aa16.04■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 GJB1P08034 283 aa16.04■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 XBP1P17861 261 aa16.04■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 CYP2C19P33261 490 aa16.04■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 SCRN1Q12765 414 aa16.04■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa16.04■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 GTF3C6Q969F1 213 aa16.04■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 RMDN3Q96TC7 470 aa16.04■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.04■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 STK36Q9NRP7 1315 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 SOWAHBA6NEL2 793 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 GNA11P29992 359 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 PDE4DQ08499 809 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 ME3Q16798 604 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 ARHGEF16Q5VV41 709 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 WWC2Q6AWC2 1192 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 ARMCX2Q7L311 632 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 BICD2Q8TD16 824 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 MORC4Q8TE76 937 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 PHKBQ93100 1093 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 EHMT1Q9H9B1 1298 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 VTA1Q9NP79 307 aa16.03■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 ESYT2A0FGR8 921 aa16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 SPDYE3A6NKU9 549 aa16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 OPLAHO14841 1288 aa16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 SEPT4O43236 478 aa16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 FOSP01100 380 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 CYBAP13498 195 aa16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 CNGA1P29973 690 aa16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 ADCY7P51828 1080 aa16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 ACVR2BQ13705 512 aa16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 UNC93B1Q9H1C4 597 aa16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 C6orf50Q9HD87 102 aa16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 RIC8AQ9NPQ8 531 aa16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 FAM184BQ9ULE4 1060 aa16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa16.02■□□□□ 0.16
C6orf136-211ENST00000487873 SMCO2A6NFE2 343 aa16.01■□□□□ 0.15
C6orf136-211ENST00000487873 STXBP3O00186 592 aa16.01■□□□□ 0.15
C6orf136-211ENST00000487873 MYCP01106 439 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
C6orf136-211ENST00000487873 AKR1A1P14550 325 aa16.01■□□□□ 0.15
C6orf136-211ENST00000487873 TRIM32Q13049 653 aa16.01■□□□□ 0.15
C6orf136-211ENST00000487873 MTFR1Q15390 333 aa16.01■□□□□ 0.15
C6orf136-211ENST00000487873 STXBP2Q15833 593 aa16.01■□□□□ 0.15
C6orf136-211ENST00000487873 GALNT17Q6IS24 598 aa16.01■□□□□ 0.15
C6orf136-211ENST00000487873 XRRA1Q6P2D8 792 aa16.01■□□□□ 0.15
C6orf136-211ENST00000487873 FGD4Q96M96 766 aa16.01■□□□□ 0.15
C6orf136-211ENST00000487873 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms