RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 LGR4Q9BXB1 951 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 CLEC1BQ9P126 229 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 F8W031 263 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 DBHP09172 617 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 PI3P19957 117 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 MAPKAPK2P49137 400 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 SSPNQ14714 243 aa6.72□□□□□ -1.33
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RABGGTB-210ENST00000485459 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 C1QL4Q86Z23 238 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGGTB-210ENST00000485459 GULP1Q9UBP9 304 aa6.72□□□□□ -1.33
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RABGGTB-210ENST00000485459 NPHS1O60500 1241 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 PLS3P13797 630 aa6.71□□□□□ -1.34
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RABGGTB-210ENST00000485459 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.71□□□□□ -1.34
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RABGGTB-210ENST00000485459 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 LDHDQ86WU2 507 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 AGRPO00253 132 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 GJB6O95452 261 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 ITGAVP06756 1048 aa6.7□□□□□ -1.34
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RABGGTB-210ENST00000485459 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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RABGGTB-210ENST00000485459 ST7Q9NRC1 585 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 BTG4Q9NY30 223 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 THBDP07204 575 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 PFKLP17858 780 aa6.69□□□□□ -1.34
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RABGGTB-210ENST00000485459 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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RABGGTB-210ENST00000485459 FUCA1P04066 466 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 GLI4P10075 376 aa6.68□□□□□ -1.34
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RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 HOXC12P31275 282 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 ALG3Q92685 438 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 PEX11GQ96HA9 241 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 GMLQ99445 158 aa6.67□□□□□ -1.34
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RABGGTB-210ENST00000485459 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.67□□□□□ -1.34
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RABGGTB-210ENST00000485459 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 MBLAC2Q68D91 279 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 IQCEQ6IPM2 695 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 NETO2Q8NC67 525 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 FRS2Q8WU20 508 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC140Q96MF4 163 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 PWWP2AQ96N64 755 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 EPN3Q9H201 632 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 MYO1BO43795 1136 aa6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RABGGTB-210ENST00000485459 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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