RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 RNF146Q9NTX7 359 aa18.74■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 CLIP2Q9UDT6 1046 aa18.74■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 NOD1Q9Y239 953 aa18.74■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 HMMRO75330 724 aa18.73■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 CPT1AP50416 773 aa18.73■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 WDR5P61964 334 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 HFE2Q6ZVN8 426 aa18.73■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 MFSD14AQ96MC6 490 aa18.73■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 TANC1Q9C0D5 1861 aa18.72■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 POTEB3A0JP26 581 aa18.72■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 NBPF20Q3BBV1 942 aa18.72■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 SLFNL1Q499Z3 407 aa18.72■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 CTR9Q6PD62 1173 aa18.72■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 POTEBQ6S5H4 581 aa18.72■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 ERC1Q8IUD2 1116 aa18.72■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 STK11IPQ8N1F8 1099 aa18.72■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 PHOX2BQ99453 314 aa18.72■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 MKNK2Q9HBH9 465 aa18.72■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 VTA1Q9NP79 307 aa18.72■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa18.72■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 H3BQ06 376 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 ST18O60284 1047 aa18.71■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 FDX1P10109 184 aa18.71■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 ADD2P35612 726 aa18.71■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 ERVK-21P61565 698 aa18.71■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 DUSP28Q4G0W2 176 aa18.71■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa18.71■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 FAM50BQ9Y247 325 aa18.71■□□□□ 0.59
SRPRB-204ENST00000484684 ALAS1P13196 640 aa18.7■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 RASA1P20936 1047 aa18.7■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 DEFB103AP81534 67 aa18.7■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 IKQ13123 557 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 EP400NLQ6ZTU2 488 aa18.7■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC155Q8N6L0 562 aa18.7■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 ANKS1AQ92625 1134 aa18.7■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 TRERF1Q96PN7 1200 aa18.7■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 RAD9AQ99638 391 aa18.7■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 DCTPP1Q9H773 170 aa18.7■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 LINC01553A4QN01 128 aa18.69■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 TKFCQ3LXA3 575 aa18.69■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 NFRKBQ6P4R8 1299 aa18.69■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 OR6J1Q8NGC5 347 aa18.69■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 NEK9Q8TD19 979 aa18.69■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 KIF1BPQ96EK5 621 aa18.69■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 WDR11Q9BZH6 1224 aa18.69■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.69■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 PTPRSQ13332 1948 aa18.68■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 TMEM232C9JQI7 657 aa18.68■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 GJB5O95377 273 aa18.68■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 BMP3P12645 472 aa18.68■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 STAT2P52630 851 aa18.68■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 CHMP4BP1P59074 171 aa18.68■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 ZP2Q05996 745 aa18.68■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 FBXO22Q8NEZ5 403 aa18.68■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 PRKAG3Q9UGI9 489 aa18.68■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 RAD50Q92878 1312 aa18.68■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 TET1Q8NFU7 2136 aa18.67■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 IGHDP01880 384 aa18.67■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 PTPROQ16827 1216 aa18.67■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 SLFN13Q68D06 897 aa18.67■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 FAM117BQ6P1L5 589 aa18.67■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 CNKSR3Q6P9H4 555 aa18.67■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 NSMFQ6X4W1 530 aa18.67■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 AFAP1L1Q8TED9 768 aa18.67■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 PAG1Q9NWQ8 432 aa18.67■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 CYP39A1Q9NYL5 469 aa18.67■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 CTNNA3Q9UI47 895 aa18.67■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 PTPN5P54829 565 aa18.66■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa18.66■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 ADHFE1Q8IWW8 467 aa18.66■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa18.66■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 CAGE1Q8TC20 777 aa18.66■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 CHURC1Q8WUH1 139 aa18.66■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 MYH4Q9Y623 1939 aa18.66■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF318Q5VUA4 2279 aa18.66■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 SIP14410 1827 aa18.65■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 KPNA6O60684 536 aa18.65■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 RAB11FIP3O75154 756 aa18.65■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 TTLL1O95922 423 aa18.65■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 PTGISQ16647 500 aa18.65■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 TIGD5Q53EQ6 642 aa18.65■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 MUM1L1Q5H9M0 696 aa18.65■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 TSHZ3Q63HK5 1081 aa18.65■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 FAM160B2Q86V87 743 aa18.65■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
SRPRB-204ENST00000484684 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.2 ms