RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 FAM126BQ8IXS8 530 aa25.27■■□□□ 1.64
USP40-215ENST00000484528 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
USP40-215ENST00000484528 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa25.27■■□□□ 1.64
USP40-215ENST00000484528 KAT14Q9H8E8 782 aa25.27■■□□□ 1.64
USP40-215ENST00000484528 WDR19Q8NEZ3 1342 aa25.27■■□□□ 1.64
USP40-215ENST00000484528 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
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USP40-215ENST00000484528 TTC22Q5TAA0 569 aa25.25■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.25■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 TNKSO95271 1327 aa25.25■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 CUL9Q8IWT3 2517 aa25.25■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
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USP40-215ENST00000484528 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 CCDC178Q5BJE1 867 aa25.24■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.24■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 PNMA2Q9UL42 364 aa25.24■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 GRIN2DO15399 1336 aa25.23■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 PDE4DQ08499 809 aa25.23■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 ITGA7Q13683 1181 aa25.23■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 DUSP28Q4G0W2 176 aa25.23■■□□□ 1.63
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USP40-215ENST00000484528 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 WDR11Q9BZH6 1224 aa25.23■■□□□ 1.63
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USP40-215ENST00000484528 ZEB2O60315 1214 aa25.22■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 CABYRO75952 493 aa25.22■■□□□ 1.63
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USP40-215ENST00000484528 ADGRF4Q8IZF3 695 aa25.22■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 ANKS1AQ92625 1134 aa25.22■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.22■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 KRT23Q9C075 422 aa25.22■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 Q9Y3F1 56 aa25.22■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 CD4P01730 458 aa25.21■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 CYP2C18P33260 490 aa25.21■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 NT5C2P49902 561 aa25.21■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 ASPRV1Q53RT3 343 aa25.21■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 SLC43A3Q8NBI5 491 aa25.21■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 CNNM2Q9H8M5 875 aa25.21■■□□□ 1.63
USP40-215ENST00000484528 UMODL1Q5DID0 1318 aa25.2■■□□□ 1.62
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USP40-215ENST00000484528 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa25.2■■□□□ 1.62
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USP40-215ENST00000484528 ACRP10323 421 aa25.2■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
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USP40-215ENST00000484528 C16orf59Q7L2K0 433 aa25.2■■□□□ 1.62
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USP40-215ENST00000484528 VAT1LQ9HCJ6 419 aa25.2■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25.2■■□□□ 1.62
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USP40-215ENST00000484528 EDNRBP24530 442 aa25.19■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.19■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 CYB5R4Q7L1T6 521 aa25.19■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 TMEM199Q8N511 208 aa25.19■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 OR6J1Q8NGC5 347 aa25.19■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 A0A0C4DFX4 3053 aa25.19■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa25.18■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 ABCB11O95342 1321 aa25.18■■□□□ 1.62
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USP40-215ENST00000484528 DNERQ8NFT8 737 aa25.18■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 COPS5Q92905 334 aa25.18■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 HIPK3Q9H422 1215 aa25.18■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 CDH23Q9H251 3354 aa25.18■■□□□ 1.62
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USP40-215ENST00000484528 TMEM240Q5SV17 173 aa25.17■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 STAG2Q8N3U4 1231 aa25.17■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa25.17■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 JMJD4Q9H9V9 463 aa25.17■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 COL20A1Q9P218 1284 aa25.17■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 CHMLP26374 656 aa25.16■■□□□ 1.62
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USP40-215ENST00000484528 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.16■■□□□ 1.62
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USP40-215ENST00000484528 DLL1O00548 723 aa25.15■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 ARIH2O95376 493 aa25.15■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 CCL23P55773 120 aa25.15■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 RGS22Q8NE09 1264 aa25.15■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
USP40-215ENST00000484528 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.15■■□□□ 1.62
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