RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, human

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHQ1-208	ENST00000482785	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	EDA	Q92838	391 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	TMEM74	Q96NL1	305 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	NCAPD2	Q15021	1401 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	DNAJC6	O75061	913 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	PHKG2	P15735	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	ETFB	P38117	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	CCR10	P46092	362 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	CCL15	Q16663	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	C4orf17	Q53FE4	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	CHRD	Q9H2X0	955 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	GINM1	Q9NU53	330 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	OTOF	Q9HC10	1997 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SHQ1-208	ENST00000482785	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	EREG	O14944	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	RTP1	P59025	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	ZP2	Q05996	745 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	RASA3	Q14644	834 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	SV2B	Q7L1I2	683 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	MEIOB	Q8N635	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	USP20	Q9Y2K6	914 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	AKAP13	Q12802	2813 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	RLF	Q13129	1914 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	ROCK1	Q13464	1354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	RTL9	Q8NET4	1388 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	FAM187A	A6NFU0	413 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	GREM1	O60565	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	XYLB	O75191	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	EDN3	P14138	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	CES1	P23141	567 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	AMPH	P49418	695 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	MAP3K10	Q02779	954 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	OPTN	Q96CV9	577 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SHQ1-208	ENST00000482785	RHOV	Q96L33	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms