RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.63■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.62■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.62■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.62■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 ESR2Q92731 530 aa22.62■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.62■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.62■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 HIPK3Q9H422 1215 aa22.62■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.61■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.61■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 GRIN2CQ14957 1233 aa22.61■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.61■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 NEDD4P46934 1319 aa22.6■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.6■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 B4GALT4O60513 344 aa22.6■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 SNHG28P0DPA3 235 aa22.6■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 CCL23P55773 120 aa22.6■■□□□ 1.21
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SHQ1-206ENST00000471526 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 TIFAQ96CG3 184 aa22.6■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.6■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 CPVLQ9H3G5 476 aa22.6■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 IL23AQ9NPF7 189 aa22.6■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.6■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 PNMA2Q9UL42 364 aa22.6■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 A0A0C4DFX4 3053 aa22.59■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 PBX2P40425 430 aa22.59■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 PDE4DQ08499 809 aa22.59■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 USH1GQ495M9 461 aa22.59■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.59■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.59■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.59■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF576Q9H609 170 aa22.59■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.58■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 KDM4AO75164 1064 aa22.58■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 FGBP02675 491 aa22.58■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 MYL3P08590 195 aa22.58■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 RASIP1Q5U651 963 aa22.58■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 DGKHQ86XP1 1220 aa22.58■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.58■■□□□ 1.21
SHQ1-206ENST00000471526 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.57■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 IQCA1Q86XH1 822 aa22.57■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 PBX4Q9BYU1 374 aa22.57■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.57■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 CPT1AP50416 773 aa22.56■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.56■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.56■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 PNMA1Q8ND90 353 aa22.56■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 HERVK_113Q902F9 699 aa22.56■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 KAT14Q9H8E8 782 aa22.56■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 B4E1Z4 1266 aa22.55■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 HIP1O00291 1037 aa22.55■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 DNERQ8NFT8 737 aa22.55■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 CYP2C9P11712 490 aa22.54■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 EDNRBP24530 442 aa22.54■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 PPP2R5BQ15173 497 aa22.54■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 TBC1D5Q92609 795 aa22.54■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 COPS5Q92905 334 aa22.54■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.54■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.54■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.54■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 B4DLN1 442 aa22.53■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.53■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.53■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 SCFD2Q8WU76 684 aa22.53■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.53■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 SCLYQ96I15 445 aa22.53■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.53■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.53■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 MSRAQ9UJ68 235 aa22.53■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.52■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 NT5C2P49902 561 aa22.52■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 RGS22Q8NE09 1264 aa22.52■■□□□ 1.2
SHQ1-206ENST00000471526 ANKS1AQ92625 1134 aa22.52■■□□□ 1.2
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