RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 CCL23P55773 120 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF543Q08ER8 600 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 TAPT1Q6NXT6 567 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 BTNL9Q6UXG8 535 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF365Q70YC5 407 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 TBC1D10CQ8IV04 446 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 SMC5Q8IY18 1101 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 OR6J1Q8NGC5 347 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 PPM1EQ8WY54 764 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 TRPV6Q9H1D0 765 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 CPVLQ9H3G5 476 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 VTA1Q9NP79 307 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 TBX21Q9UL17 535 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 ASTN1O14525 1302 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 LRRC37A2A6NM11 1700 aa10.03□□□□□ -0.8
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SH3BP1-204ENST00000459646 HIP1O00291 1037 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 CTAGE5O15320 804 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 FGBP02675 491 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 PCP11498 1178 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 NUCB1Q02818 461 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
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SH3BP1-204ENST00000459646 SLC30A10Q6XR72 485 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM126BQ8IXS8 530 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 PNMA1Q8ND90 353 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa10.03□□□□□ -0.8
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SH3BP1-204ENST00000459646 HIPK3Q9H422 1215 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 POLR3EQ9NVU0 708 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 CTNNA3Q9UI47 895 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 PNMA2Q9UL42 364 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 NEDD4P46934 1319 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-204ENST00000459646 LAMA4Q16363 1823 aa10.03□□□□□ -0.8
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SH3BP1-204ENST00000459646 TXNP10599 105 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
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SH3BP1-204ENST00000459646 RPS6P62753 249 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
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SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM240Q5SV17 173 aa10.02□□□□□ -0.81
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SH3BP1-204ENST00000459646 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
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SH3BP1-204ENST00000459646 C16orf59Q7L2K0 433 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 CHST3Q7LGC8 479 aa10.02□□□□□ -0.81
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SH3BP1-204ENST00000459646 DEFB128Q7Z7B8 93 aa10.01□□□□□ -0.81
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SH3BP1-204ENST00000459646 KRT23Q9C075 422 aa10.01□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 OSBPL3Q9H4L5 887 aa10.01□□□□□ -0.81
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SH3BP1-204ENST00000459646 CFBP00751 764 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 CYP2C9P11712 490 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 IGFBP4P22692 258 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 TRDNQ13061 729 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 TTLL4Q14679 1199 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 FBXO11Q86XK2 927 aa10□□□□□ -0.81
SH3BP1-204ENST00000459646 MCF2L2Q86YR7 1114 aa10□□□□□ -0.81
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