RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 PSMA5P28066 241 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 KRT83P78385 493 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 COL19A1Q14993 1142 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PMM1Q92871 262 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 USP28Q96RU2 1077 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 STK39Q9UEW8 545 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 NRBP1Q9UHY1 535 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 GGA2Q9UJY4 613 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TTI1O43156 1089 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TSPAN1O60635 241 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 GAS8O95995 478 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 HMOX2P30519 316 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 USP46P62068 366 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PPARDQ03181 441 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM60Q495X7 471 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 NME9Q86XW9 330 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 C8orf48Q96LL4 319 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 EID1Q9Y6B2 187 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-209ENST00000442510 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 NVLO15381 856 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 IGHDP01880 384 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 DNA2P51530 1060 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 BFSP1Q12934 665 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PPP2R5CQ13362 524 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 KRT71Q3SY84 523 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 FYB2Q5VWT5 728 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ALS2CLQ60I27 953 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
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PTPRC-209ENST00000442510 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ABLIM1O14639 778 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 APAF1O14727 1248 aa6.08□□□□□ -1.44
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PTPRC-209ENST00000442510 ACADSP16219 412 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CDC25BP30305 580 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PLCD1P51178 756 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 IST1P53990 364 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ATP8B2P98198 1209 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 UBXN1Q04323 297 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MTMR3Q13615 1198 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CEP55Q53EZ4 464 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 IFNL1Q8IU54 200 aa6.08□□□□□ -1.44
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP45Q92619 1136 aa6.08□□□□□ -1.44
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PTPRC-209ENST00000442510 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 STK4Q13043 487 aa6.08□□□□□ -1.44
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