RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-208ENST00000436673 MYLIPQ8WY64 445 aa31.08■■■□□ 2.57
UPP1-208ENST00000436673 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa31.08■■■□□ 2.57
UPP1-208ENST00000436673 PNMA2Q9UL42 364 aa31.08■■■□□ 2.57
UPP1-208ENST00000436673 NEDD4P46934 1319 aa31.07■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 PTPDC1A2A3K4 754 aa31.07■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 TMEM240Q5SV17 173 aa31.07■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 SLC30A10Q6XR72 485 aa31.07■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 ESR2Q92731 530 aa31.07■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa31.06■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 DUSP28Q4G0W2 176 aa31.06■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 WDR19Q8NEZ3 1342 aa31.05■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 ZNF213O14771 459 aa31.05■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 DNAJB2P25686 324 aa31.05■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 RASIP1Q5U651 963 aa31.05■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa31.05■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 CALML3P27482 149 aa31.04■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 CYP2C18P33260 490 aa31.04■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 RNF207Q6ZRF8 634 aa31.04■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 DGKHQ86XP1 1220 aa31.04■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa31.04■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 WDR11Q9BZH6 1224 aa31.04■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 NT5C2P49902 561 aa31.03■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 HIPK3Q9H422 1215 aa31.03■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa31.03■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 ACRP10323 421 aa31.02■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 PSMC6P62333 389 aa31.02■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 RPS6P62753 249 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 ZNF365Q70YC5 407 aa31.02■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 TRPV6Q9H1D0 765 aa31.02■■■□□ 2.56
UPP1-208ENST00000436673 GOLGA8HP0CJ92 632 aa31.01■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 FOSL2P15408 326 aa31.01■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 EXOC6Q8TAG9 804 aa31.01■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 IL23AQ9NPF7 189 aa31.01■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 UMODL1Q5DID0 1318 aa31■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 B4GALT4O60513 344 aa31■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 EDNRBP24530 442 aa31■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 TIFAQ96CG3 184 aa31■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 HIP1O00291 1037 aa30.99■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 KDM4AO75164 1064 aa30.99■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 GRIN2CQ14957 1233 aa30.99■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 CCDC178Q5BJE1 867 aa30.99■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 IQCA1Q86XH1 822 aa30.99■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 DNERQ8NFT8 737 aa30.99■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 UBA5Q9GZZ9 404 aa30.99■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 CPVLQ9H3G5 476 aa30.99■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 PDE4DQ08499 809 aa30.98■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 PNMA1Q8ND90 353 aa30.98■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 ANKS1AQ92625 1134 aa30.98■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 DSCC1Q9BVC3 393 aa30.98■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 ZNF576Q9H609 170 aa30.98■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 VCANP13611 3396 aa30.98■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 GRXCR1A8MXD5 290 aa30.97■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 CPT1AP50416 773 aa30.97■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 PURAQ00577 322 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 USH1GQ495M9 461 aa30.97■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 RGS22Q8NE09 1264 aa30.97■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 HERVK_113Q902F9 699 aa30.97■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 PBX4Q9BYU1 374 aa30.97■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 POLR3EQ9NVU0 708 aa30.97■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 LAMA4Q16363 1823 aa30.96■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 B4E1Z4 1266 aa30.96■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 PBX2P40425 430 aa30.96■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 OR6J1Q8NGC5 347 aa30.96■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 KAT14Q9H8E8 782 aa30.96■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 CHD9Q3L8U1 2897 aa30.95■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 CCL23P55773 120 aa30.95■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 PPP2R5BQ15173 497 aa30.95■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 WNT8AQ9H1J5 351 aa30.95■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 ZSWIM5Q9P217 1185 aa30.95■■■□□ 2.55
UPP1-208ENST00000436673 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP30.94■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 FGBP02675 491 aa30.94■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 SCFD2Q8WU76 684 aa30.94■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 MYL3P08590 195 aa30.93■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 ASPRV1Q53RT3 343 aa30.93■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 ADGRF4Q8IZF3 695 aa30.93■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 MAF1Q9H063 256 aa30.93■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 CTNNA3Q9UI47 895 aa30.93■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 B4DLN1 442 aa30.92■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 TNKSO95271 1327 aa30.92■■■□□ 2.54
UPP1-208ENST00000436673 RAD50Q92878 1312 aa30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms