RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436066.3

PLEKHF1-201, Transcript of pleckstrin homology and FYVE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHF1, Length 2,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1-201ENST00000436066 DCAF4Q8WV16 495 aa28.37■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 ANKRD7Q92527 254 aa28.37■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.37■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 ASIC1P78348 528 aa28.36■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDE4DQ08499 809 aa28.36■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 ITIH6Q6UXX5 1313 aa28.36■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 GDF11O95390 407 aa28.36■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 CASP14P31944 242 aa28.36■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 ICA1Q05084 483 aa28.36■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPP4R3AQ6IN85 833 aa28.36■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 RAB34Q9BZG1 259 aa28.36■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 EXOC1Q9NV70 894 aa28.36■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 PPIP5K2O43314 1243 aa28.35■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 GRB10Q13322 594 aa28.35■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 QRICH1Q2TAL8 776 aa28.35■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIM65Q6PJ69 517 aa28.35■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 TMEM179Q6ZVK1 233 aa28.35■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 IRF2BP1Q8IU81 584 aa28.35■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 SIAH1Q8IUQ4 282 aa28.35■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 DNAI1Q9UI46 699 aa28.35■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 POTEMA6NI47 508 aa28.34■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 MFAP3LO75121 409 aa28.34■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 GYPCP04921 128 aa28.34■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.34■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 TRIM47Q96LD4 638 aa28.34■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 STK32BQ9NY57 414 aa28.34■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 C21orf2O43822 256 aa28.34■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDIA5Q14554 519 aa28.34■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 ABCB5Q2M3G0 1257 aa28.34■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa28.34■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 YDJCA8MPS7 323 aa28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 SV2BQ7L1I2 683 aa28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 PNMA5Q96PV4 448 aa28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 SOWAHDA6NJG2 315 aa28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 TPM1P09493 284 aa28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 MTF1Q14872 753 aa28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 CNGA4Q8IV77 575 aa28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa28.33■■■□□ 2.13
PLEKHF1-201ENST00000436066 STK4Q13043 487 aa28.32■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 TTI2Q6NXR4 508 aa28.32■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 DESI2Q9BSY9 194 aa28.32■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 THAP9Q9H5L6 903 aa28.32■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 L2HGDHQ9H9P8 463 aa28.32■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 STK17AQ9UEE5 414 aa28.32■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 USP17L15C9J2P7 530 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 USP17L13C9JLJ4 530 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 USP17L11C9JVI0 530 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 USP17L18D6R9N7 530 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 USP17L22D6RA61 530 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 USP17L17D6RBQ6 530 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 USP17L19D6RCP7 530 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 USP17L20D6RJB6 530 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 F5H6K3 240 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 ENTPD3O75355 529 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 SLU7O95391 586 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
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PLEKHF1-201ENST00000436066 KLRC3Q07444 240 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 USP17L24Q0WX57 530 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 USP17L6PQ6QN14 398 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 SNX29Q8TEQ0 813 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 UBXN1Q04323 297 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 MCM6Q14566 821 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 KRT79Q5XKE5 535 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 ATRNL1Q5VV63 1379 aa28.31■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 HAS1Q92839 578 aa28.3■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.3■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 NUDT12Q9BQG2 462 aa28.3■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 GLT8D2Q9H1C3 349 aa28.3■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 MARCH6O60337 910 aa28.3■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 PDCL2Q8N4E4 241 aa28.3■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 P2RX5Q93086 422 aa28.3■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCDC51Q96ER9 411 aa28.3■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 ERO1AQ96HE7 468 aa28.3■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 CCNE1P24864 410 aa28.29■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 CNNM4Q6P4Q7 775 aa28.29■■■□□ 2.12
PLEKHF1-201ENST00000436066 RAD9BQ6WBX8 426 aa28.29■■■□□ 2.12
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