RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 TRIM9Q9C026 710 aa21.99■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 SV2BQ7L1I2 683 aa21.99■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 TADA3O75528 432 aa21.98■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC122Q5T0U0 273 aa21.98■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.98■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.98■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.98■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 SLC1A4P43007 532 aa21.98■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.98■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 PARD6BQ9BYG5 372 aa21.98■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 PHACTR2O75167 634 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 APBA1Q02410 837 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 MB21D1Q8N884 522 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 CTAGE9A4FU28 777 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 MYMKA6NI61 221 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 CHMP4BP1P59074 171 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM266Q2M3C6 531 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 PANX2Q96RD6 677 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 E9PMD0 336 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 KLRC4O43908 158 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 HLA-DOAP06340 250 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 CYP4A11Q02928 519 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 SPAG1Q07617 926 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 KRT79Q5XKE5 535 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 DEF6Q9H4E7 631 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 CLRN2A0PK11 232 aa21.96■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 H7C1D1 291 aa21.96■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 SEPT2Q15019 361 aa21.96■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.96■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 FEZ1Q99689 392 aa21.96■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.96■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 P2RX5Q93086 422 aa21.96■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.96■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TTLL3-210ENST00000427220 PROM2Q8N271 834 aa21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 CAGE1Q8TC20 777 aa21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 TEKT1Q969V4 418 aa21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 TTLL1O95922 423 aa21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 IL1R1P14778 569 aa21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 KIAA1024Q9UPX6 916 aa21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 MYO1BO43795 1136 aa21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 OR8K1Q8NGG5 319 aa21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 KIFC2Q96AC6 838 aa21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 MRFAP1Q9Y605 127 aa21.95■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.94■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.94■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa21.94■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 CHMP2AO43633 222 aa21.94■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 TMTC1Q8IUR5 882 aa21.94■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.94■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 JADE2Q9NQC1 790 aa21.94■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 DOCK2Q92608 1830 aa21.94■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 M0R2N6 131 aa21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 TRAF5O00463 557 aa21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 MAP3K9P80192 1104 aa21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 ECM1Q16610 540 aa21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 PRR16Q569H4 304 aa21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 RGS22Q8NE09 1264 aa21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 DDX12PQ92771 950 aa21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 NDUFA10O95299 355 aa21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 PPARDQ03181 441 aa21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 GRB10Q13322 594 aa21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 GOLGA1Q92805 767 aa21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.93■■□□□ 1.1
TTLL3-210ENST00000427220 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms