RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 CABP7Q86V35 215 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 RASSF8Q8NHQ8 419 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 VPS16Q9H269 839 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 MYH1P12882 1939 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 BICDL2A1A5D9 508 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 ZNF507Q8TCN5 953 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 TAB2Q9NYJ8 693 aa26.68■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 CDC25AP30304 524 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 MB21D1Q8N884 522 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 CEP112Q8N8E3 955 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 RETREG2Q8NC44 543 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA1Q92805 767 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 PRDM4Q9UKN5 801 aa26.67■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 DNM2P50570 870 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 DOK7Q18PE1 504 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 TTI2Q6NXR4 508 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 FAM114A1Q8IWE2 563 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 IQCDQ96DY2 449 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 KIF20AO95235 890 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 UBXN1Q04323 297 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 ASPRV1Q53RT3 343 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 ZNF662Q6ZS27 426 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 NUP58Q9BVL2 599 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 CDC23Q9UJX2 597 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 FHOD1Q9Y613 1164 aa26.66■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 SCN9AQ15858 1988 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 CCNE1P24864 410 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 OR8K1Q8NGG5 319 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 CEP95Q96GE4 821 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC7Q99615 494 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 PRDM10Q9NQV6 1147 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.65■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 KRT9P35527 623 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 ERVK-24P63145 666 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 TRIM9Q9C026 710 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 CAPN11Q9UMQ6 739 aa26.64■■□□□ 1.86
PMS1-205ENST00000409985 PP2D1A8MPX8 630 aa26.64■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 POTEB2H3BUK9 544 aa26.64■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 SNHG28P0DPA3 235 aa26.64■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 PLCG1P19174 1290 aa26.64■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.64■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 STK17AQ9UEE5 414 aa26.64■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.63■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 PPIP5K2O43314 1243 aa26.63■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA8HP0CJ92 632 aa26.63■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
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PMS1-205ENST00000409985 LZTFL1Q9NQ48 299 aa26.63■■□□□ 1.85
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PMS1-205ENST00000409985 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 LETM2Q2VYF4 491 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 P2RX5Q93086 422 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 CALML4Q96GE6 196 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 TRIM47Q96LD4 638 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 SBF1O95248 1867 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 CNNM4Q6P4Q7 775 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 FOXR2Q6PJQ5 311 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 MTMR9Q96QG7 549 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 EXOC1Q9NV70 894 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26.62■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 YDJCA8MPS7 323 aa26.61■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 PDHBP11177 359 aa26.61■■□□□ 1.85
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PMS1-205ENST00000409985 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
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PMS1-205ENST00000409985 TBCKQ8TEA7 893 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 PIGSQ96S52 555 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 MYH8P13535 1937 aa26.6■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP25P42331 645 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 PMS1P54277 932 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 BRD3Q15059 726 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 GPR162Q16538 588 aa26.59■■□□□ 1.85
PMS1-205ENST00000409985 MEA1Q16626 185 aa26.59■■□□□ 1.85
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