RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 ZBED4O75132 1171 aa22.93■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.93■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 USP49Q70CQ1 688 aa22.93■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.93■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 CSRNP2Q9H175 543 aa22.93■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.93■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 CUTAO60888 179 aa22.92■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 CMA1P23946 247 aa22.92■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 CAMK4Q16566 473 aa22.92■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.92■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 PIK3CDO00329 1044 aa22.92■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 SLC37A4O43826 429 aa22.92■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 PFKFB1P16118 471 aa22.92■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.92■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.92■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 SYCE3A1L190 88 aa22.91■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 TRAF1Q13077 416 aa22.91■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 RESP18Q5W5W9 173 aa22.91■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 POTEDQ86YR6 584 aa22.91■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 BMP15O95972 392 aa22.9■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.9■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 AP3B2Q13367 1082 aa22.9■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.9■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.9■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.9■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.9■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 NEMFO60524 1076 aa22.9■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 POLR2MP0CAP2 368 aa22.9■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 FKBP1BP68106 108 aa22.9■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.9■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 UIMC1Q96RL1 719 aa22.9■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 COL20A1Q9P218 1284 aa22.9■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 PLS1Q14651 629 aa22.89■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.89■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 GJA10Q969M2 543 aa22.89■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 EPSTI1Q96J88 318 aa22.89■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.89■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.89■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 UBXN2AP68543 259 aa22.88■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 ARHGAP4P98171 946 aa22.88■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.88■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 FDX1P10109 184 aa22.88■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 SNAPC2Q13487 334 aa22.88■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 FERMT2Q96AC1 680 aa22.88■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.88■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 PANK2Q9BZ23 570 aa22.88■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 BTBD7Q9P203 1132 aa22.88■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 HPSEQ9Y251 543 aa22.88■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 CDC25AP30304 524 aa22.87■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 HSD17B4P51659 736 aa22.87■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 RNF146Q9NTX7 359 aa22.87■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 MYPNQ86TC9 1320 aa22.87■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 UNCXA6NJT0 531 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 SREBF1P36956 1147 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 GSE1Q14687 1217 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 ZNF202O95125 648 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 OR52Z1P0C646 297 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 HUNKP57058 714 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 A0A087X0B3 334 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 PP2D1A8MPX8 630 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 OAZ1P54368 228 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 LBX2Q6XYB7 198 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 MTMR9Q96QG7 549 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.85■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 FAM86B1E9PN63 330 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 KIF3CO14782 793 aa22.84■■□□□ 1.25
ODC1-202ENST00000405333 ATP2A1O14983 1001 aa22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms