RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 A0A1B0GVL5 298 aa23.31■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 PIK3CDO00329 1044 aa23.31■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 PTPREP23469 700 aa23.31■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 TBC1D5Q92609 795 aa23.31■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 DACT1Q9NYF0 836 aa23.31■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.31■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 PLS1Q14651 629 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 FERMT2Q96AC1 680 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 NR1I2O75469 434 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 CMA1P23946 247 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 OAZ1P54368 228 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 GRIN1Q05586 938 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 CST9Q5W186 159 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 REPS2Q8NFH8 660 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 NFIBO00712 420 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 NEMFO60524 1076 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 SPECC1Q5M775 1068 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 SHC4Q6S5L8 630 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 TDP2O95551 362 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 CSRNP2Q9H175 543 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 RNF146Q9NTX7 359 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 PFKFB1P16118 471 aa23.27■■□□□ 1.32
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ATG4B-204ENST00000402096 NDUFA8P51970 172 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 HUNKP57058 714 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 RESP18Q5W5W9 173 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
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ATG4B-204ENST00000402096 GTF2A2P52657 109 aa23.26■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGAP4P98171 946 aa23.26■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 MOGSQ13724 837 aa23.26■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 POTEDQ86YR6 584 aa23.26■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.26■■□□□ 1.31
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ATG4B-204ENST00000402096 OR52Z1P0C646 297 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 CETPP11597 493 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 STAT3P40763 770 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 USP11P51784 963 aa23.25■■□□□ 1.31
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ATG4B-204ENST00000402096 EDIL3O43854 480 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 SREBF1P36956 1147 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 HSD17B4P51659 736 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 CAMK4Q16566 473 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 NSMFQ6X4W1 530 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 MB21D1Q8N884 522 aa23.25■■□□□ 1.31
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ATG4B-204ENST00000402096 SLC37A4O43826 429 aa23.24■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 HERVK_113P62684 666 aa23.24■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
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ATG4B-204ENST00000402096 CCL15Q16663 113 aa23.24■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 SPRYD7Q5W111 196 aa23.24■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 ENGASEQ8NFI3 743 aa23.24■■□□□ 1.31
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ATG4B-204ENST00000402096 SYCE3A1L190 88 aa23.23■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 MARCH6O60337 910 aa23.23■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF76P36508 570 aa23.23■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 SYKP43405 635 aa23.23■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 TKFCQ3LXA3 575 aa23.23■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 LBX2Q6XYB7 198 aa23.23■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.23■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.23■■□□□ 1.31
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
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