RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 SGPL1O95470 568 aa23.61■■□□□ 1.37
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CLDN3-201ENST00000395145 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.61■■□□□ 1.37
CLDN3-201ENST00000395145 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CLDN3-201ENST00000395145 DEFB118Q96PH6 123 aa23.61■■□□□ 1.37
CLDN3-201ENST00000395145 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa23.61■■□□□ 1.37
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CLDN3-201ENST00000395145 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
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CLDN3-201ENST00000395145 SHISA4Q96DD7 197 aa23.6■■□□□ 1.37
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
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CLDN3-201ENST00000395145 MSCO60682 206 aa23.58■■□□□ 1.37
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CLDN3-201ENST00000395145 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa23.57■■□□□ 1.36
CLDN3-201ENST00000395145 CFBP00751 764 aa23.56■■□□□ 1.36
CLDN3-201ENST00000395145 CNGA1P29973 690 aa23.56■■□□□ 1.36
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CLDN3-201ENST00000395145 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN3-201ENST00000395145 EDNRBP24530 442 aa23.55■■□□□ 1.36
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CLDN3-201ENST00000395145 COL20A1Q9P218 1284 aa23.55■■□□□ 1.36
CLDN3-201ENST00000395145 V9GY48 417 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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CLDN3-201ENST00000395145 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.52■■□□□ 1.36
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CLDN3-201ENST00000395145 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
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CLDN3-201ENST00000395145 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.5■■□□□ 1.35
CLDN3-201ENST00000395145 PXMP2Q9NR77 195 aa23.5■■□□□ 1.35
CLDN3-201ENST00000395145 BARHL2Q9NY43 387 aa23.5■■□□□ 1.35
CLDN3-201ENST00000395145 STXBP3O00186 592 aa23.49■■□□□ 1.35
CLDN3-201ENST00000395145 MEIS2O14770 477 aa23.49■■□□□ 1.35
CLDN3-201ENST00000395145 PFKFB2O60825 505 aa23.49■■□□□ 1.35
CLDN3-201ENST00000395145 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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