RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 CNMDO75829 334 aa26.57■■□□□ 1.84
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CNN3-202ENST00000394202 PAGR1Q9BTK6 254 aa26.57■■□□□ 1.84
CNN3-202ENST00000394202 RBPJLQ9UBG7 517 aa26.57■■□□□ 1.84
CNN3-202ENST00000394202 ELP1O95163 1332 aa26.56■■□□□ 1.84
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CNN3-202ENST00000394202 A0A0G2JMZ2 1700 aa26.53■■□□□ 1.84
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CNN3-202ENST00000394202 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
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CNN3-202ENST00000394202 ZIC5Q96T25 663 aa26.53■■□□□ 1.84
CNN3-202ENST00000394202 SPATC1LQ9H0A9 340 aa26.53■■□□□ 1.84
CNN3-202ENST00000394202 PNMA2Q9UL42 364 aa26.53■■□□□ 1.84
CNN3-202ENST00000394202 KCNG4Q8TDN1 519 aa26.52■■□□□ 1.84
CNN3-202ENST00000394202 CRYGNQ8WXF5 182 aa26.52■■□□□ 1.84
CNN3-202ENST00000394202 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa26.52■■□□□ 1.84
CNN3-202ENST00000394202 SPDYE3A6NKU9 549 aa26.51■■□□□ 1.83
CNN3-202ENST00000394202 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
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CNN3-202ENST00000394202 SLC30A10Q6XR72 485 aa26.51■■□□□ 1.83
CNN3-202ENST00000394202 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CNN3-202ENST00000394202 GHRHRQ02643 423 aa26.51■■□□□ 1.83
CNN3-202ENST00000394202 GRIN1Q05586 938 aa26.51■■□□□ 1.83
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CNN3-202ENST00000394202 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.51■■□□□ 1.83
CNN3-202ENST00000394202 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
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CNN3-202ENST00000394202 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
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CNN3-202ENST00000394202 TEX2Q8IWB9 1127 aa26.47■■□□□ 1.83
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CNN3-202ENST00000394202 IL17AQ16552 155 aa26.47■■□□□ 1.83
CNN3-202ENST00000394202 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CNN3-202ENST00000394202 NCAPG2Q86XI2 1143 aa26.47■■□□□ 1.83
CNN3-202ENST00000394202 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.47■■□□□ 1.83
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CNN3-202ENST00000394202 ERCC3P19447 782 aa26.46■■□□□ 1.83
CNN3-202ENST00000394202 ERVK-9P63128 1117 aa26.46■■□□□ 1.83
CNN3-202ENST00000394202 ERVK-24P63145 666 aa26.46■■□□□ 1.83
CNN3-202ENST00000394202 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CNN3-202ENST00000394202 CYP39A1Q9NYL5 469 aa26.46■■□□□ 1.83
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