RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC125Q86Z20 511 aa23.13■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 SPC25Q9HBM1 224 aa23.13■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 CLTCL1P53675 1640 aa23.12■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 SH3BP5O60239 455 aa23.12■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 STAM2O75886 525 aa23.12■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 MMP1P03956 469 aa23.12■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.12■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 KRT81Q14533 505 aa23.12■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 HACE1Q8IYU2 909 aa23.12■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 RAB20Q9NX57 234 aa23.12■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.12■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC160A6NGH7 325 aa23.12■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 BRINP3Q76B58 766 aa23.12■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.12■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 SNAP25P60880 206 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC110Q8TBZ0 833 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 POMGNT1Q8WZA1 660 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 MEIS1O00470 390 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 PIK3CAP42336 1068 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 TAOK1Q7L7X3 1001 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 KRIT1O00522 736 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 HHATQ5VTY9 493 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 RSAD2Q8WXG1 361 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 INPP5BP32019 993 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 ZSCAN26Q16670 478 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 KRT15P19012 456 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 GRAPQ13588 217 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 UBE2SQ16763 222 aa23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 LAD1O00515 517 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 NSMCE1Q8WV22 266 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 MAIP1Q8WWC4 291 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 CYP27B1O15528 508 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 A6NNZ2 444 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 CDC25AP30304 524 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 CASP14P31944 242 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 MCAMP43121 646 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 MYL7Q01449 175 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 TUBB8Q3ZCM7 444 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 DENND2CQ68D51 928 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 HYOU1Q9Y4L1 999 aa23.1■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 RESTQ13127 1097 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 NECTIN1Q15223 517 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 TMC4Q7Z404 712 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 MGARPQ8TDB4 240 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 H7C1W4 665 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 AIFM3Q96NN9 605 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 ADPGKQ9BRR6 497 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM191BP0C7N4 346 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 DMTNQ08495 405 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 RAB17Q9H0T7 212 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 VPS52Q8N1B4 723 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 PPFIA1Q13136 1202 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 POTEDQ86YR6 584 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 APOL6Q9BWW8 343 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 STIM2Q9P246 746 aa23.09■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 CIB2O75838 187 aa23.08■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 IFNB1P01574 187 aa23.08■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 TRAPPC10P48553 1259 aa23.08■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 MTMR3Q13615 1198 aa23.08■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.08■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 HINFPQ9BQA5 517 aa23.08■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 BMP3P12645 472 aa23.08■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 TBC1D31Q96DN5 1066 aa23.08■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 H0YCG3 227 aa23.08■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 SPATA24Q86W54 205 aa23.08■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.08■■□□□ 1.29
SMURF1-201ENST00000361125 ABL1P00519 1130 aa23.08■■□□□ 1.28
SMURF1-201ENST00000361125 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.08■■□□□ 1.28
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