RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXA4-201ENST00000360046 ATP2A1O14983 1001 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXA4-201ENST00000360046 YEATS4O95619 227 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXA4-201ENST00000360046 POLR2MP0CAP2 368 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXA4-201ENST00000360046 PTMSP20962 102 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXA4-201ENST00000360046 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXA4-201ENST00000360046 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXA4-201ENST00000360046 RNF146Q9NTX7 359 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXA4-201ENST00000360046 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
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HOXA4-201ENST00000360046 PIK3CDO00329 1044 aa24.95■■□□□ 1.59
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HOXA4-201ENST00000360046 AP3B2Q13367 1082 aa24.95■■□□□ 1.59
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HOXA4-201ENST00000360046 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
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HOXA4-201ENST00000360046 PEX10O60683 326 aa24.95■■□□□ 1.58
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HOXA4-201ENST00000360046 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.94■■□□□ 1.58
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HOXA4-201ENST00000360046 SREBF2Q12772 1141 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 PTPAQ15257 358 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 LETM2Q2VYF4 491 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 TKFCQ3LXA3 575 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 CAPNS2Q96L46 248 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 ZIC5Q96T25 663 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
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HOXA4-201ENST00000360046 RBPJLQ9UBG7 517 aa24.91■■□□□ 1.58
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HOXA4-201ENST00000360046 NOGQ13253 232 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 IFNL1Q8IU54 200 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 JMYQ8N9B5 988 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 TXNRD2Q9NNW7 524 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 CNMDO75829 334 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 BMP15O95972 392 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 UBE2HP62256 183 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXA4-201ENST00000360046 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.89■■□□□ 1.58
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HOXA4-201ENST00000360046 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.89■■□□□ 1.57
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HOXA4-201ENST00000360046 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
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HOXA4-201ENST00000360046 CHST13Q8NET6 341 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 PCDHA7Q9UN72 937 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
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HOXA4-201ENST00000360046 ARHGAP4P98171 946 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 TDP2O95551 362 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 TM4SF4P48230 202 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 Q3C1V9 767 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
HOXA4-201ENST00000360046 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
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