RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 USP11P51784 963 aa27.47■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 RRAGBQ5VZM2 374 aa27.47■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 TEX2Q8IWB9 1127 aa27.47■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 MTRQ99707 1265 aa27.47■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 OPLAHO14841 1288 aa27.46■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 TXKP42681 527 aa27.46■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 CABP7Q86V35 215 aa27.46■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 ZSCAN30Q86W11 494 aa27.46■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 RASSF8Q8NHQ8 419 aa27.46■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 LPAR1Q92633 364 aa27.46■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 SYT17Q9BSW7 474 aa27.46■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 DACH1Q9UI36 760 aa27.46■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF112Q9UJU3 913 aa27.46■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 UTRNP46939 3433 aa27.45■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 FOSP01100 380 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 INPP5BP32019 993 aa27.45■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 TPM4P67936 248 aa27.45■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 NAALADL2Q58DX5 795 aa27.45■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 GGA3Q9NZ52 723 aa27.45■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa27.45■■□□□ 1.99
SERF1A-202ENST00000354833 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 CASP1P29466 404 aa27.44■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 TMEM266Q2M3C6 531 aa27.44■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 STAMQ92783 540 aa27.44■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 SBF1O95248 1867 aa27.44■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 PIK3CDO00329 1044 aa27.44■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 WDR46O15213 610 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 MYL5Q02045 173 aa27.44■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 CRYGNQ8WXF5 182 aa27.44■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 FBXO28Q9NVF7 368 aa27.44■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa27.43■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 CYP3A7P24462 503 aa27.43■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 PDIA5Q14554 519 aa27.43■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC174Q6PII3 467 aa27.43■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 MOXD1Q6UVY6 613 aa27.43■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 RAB34Q9BZG1 259 aa27.43■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 CUEDC2Q9H467 287 aa27.43■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 SPDYE3A6NKU9 549 aa27.42■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 SCYL3Q8IZE3 742 aa27.42■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 CDC25BP30305 580 aa27.42■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 ARHGAP4P98171 946 aa27.42■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa27.42■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 HAS1Q92839 578 aa27.42■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa27.42■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 MBOAT7Q96N66 472 aa27.42■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 MAGEF1Q9HAY2 307 aa27.42■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 MYH7BA7E2Y1 1941 aa27.42■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 DDNO94850 711 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 SREBF1P36956 1147 aa27.41■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 CUL4BQ13620 913 aa27.41■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 BLZF1Q9H2G9 400 aa27.41■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 RNF181Q9P0P0 153 aa27.41■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 LRWD1Q9UFC0 647 aa27.41■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa27.4■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 PLCG1P19174 1290 aa27.4■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 SPC24Q8NBT2 197 aa27.4■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 WRNIP1Q96S55 665 aa27.4■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 KBTBD4Q9NVX7 518 aa27.4■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa27.4■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 MYL1P05976 194 aa27.4■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 WDR18Q9BV38 432 aa27.4■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 HSD3B7Q9H2F3 369 aa27.4■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa27.39■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 CALML4Q96GE6 196 aa27.39■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 PLIN2Q99541 437 aa27.39■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
SERF1A-202ENST00000354833 ABCB11O95342 1321 aa27.38■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 USP14P54578 494 aa27.38■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 MTMR2Q13614 643 aa27.38■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 LRRC15Q8TF66 581 aa27.38■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 SLF1Q9BQI6 1058 aa27.38■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 DOCK1Q14185 1865 aa27.38■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 LDHDQ86WU2 507 aa27.38■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 AS3MTQ9HBK9 375 aa27.38■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 KCNMB3Q9NPA1 279 aa27.38■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 RMND1Q9NWS8 449 aa27.38■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 MARCH6O60337 910 aa27.37■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 PTPRAP18433 802 aa27.37■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 MSNP26038 577 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 DRC7Q8IY82 874 aa27.37■■□□□ 1.97
SERF1A-202ENST00000354833 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms