RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 ARMT1Q9H993 441 aa21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 DISC1Q9NRI5 854 aa21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 TNKSO95271 1327 aa21.42■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 KIF11P52732 1056 aa21.42■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 ESR2Q92731 530 aa21.42■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.42■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 MYH10P35580 1976 aa21.42■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 GOLGA6L10A6NI86 522 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 PDE8BO95263 885 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CALM1P0DP23 149 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CALM2P0DP24 149 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CALM3P0DP25 149 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 SCP2P22307 547 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 PHKA1P46020 1223 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 IFFO1Q0D2I5 559 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 IL17AQ16552 155 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 P3H4Q92791 437 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CCDC114Q96M63 670 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 NFU1Q9UMS0 254 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 E7EVH7 732 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 PRDM1O75626 825 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 ERCC3P19447 782 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 LRIG3Q6UXM1 1119 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 PARP9Q8IXQ6 854 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CYFIP2Q96F07 1278 aa21.41■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 EZRP15311 586 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CARSP49589 748 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CRYMQ14894 314 aa21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 SGSM3Q96HU1 749 aa21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 BCORQ6W2J9 1755 aa21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 GRID2IPA4D2P6 1211 aa21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 GLI1P08151 1106 aa21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 SLC8A1P32418 973 aa21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CYB5D1Q6P9G0 228 aa21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 NOX5Q96PH1 765 aa21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 TLR10Q9BXR5 811 aa21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa21.4■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.39■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 KLRC4O43908 158 aa21.39■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 ITGA6P23229 1130 aa21.39■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CCNE1P24864 410 aa21.39■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 CXCR5P32302 372 aa21.39■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 KLK7P49862 253 aa21.39■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 SEC24CP53992 1094 aa21.39■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 SPATA5Q8NB90 893 aa21.39■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 EPB41L5Q9HCM4 733 aa21.39■■□□□ 1.02
NOP56-201ENST00000329276 MCM7P33993 719 aa21.39■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.39■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 FUKQ8N0W3 1084 aa21.39■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 P2RX5Q93086 422 aa21.39■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 FAM212AQ96EL1 285 aa21.39■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 FAM89AQ96GI7 184 aa21.39■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 AKR1B10O60218 316 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 MIIPQ5JXC2 388 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 CENPHQ9H3R5 247 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 MAGEF1Q9HAY2 307 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 ALS2Q96Q42 1657 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 GMNCA6NCL1 334 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 FAM153BP0C7A2 387 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 GUCY2DQ02846 1103 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 FAM153CQ494X1 144 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 TEX11Q8IYF3 940 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 LPIN2Q92539 896 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 TMBIM4Q9HC24 238 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 KBTBD4Q9NVX7 518 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 SLAIN2Q9P270 581 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 FAM153AQ9UHL3 310 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 ANAPC4Q9UJX5 808 aa21.38■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
NOP56-201ENST00000329276 BRINP3Q76B58 766 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms