RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 MORC4Q8TE76 937 aa29.45■■■□□ 2.31
PPP4R4-202ENST00000328839 LAMA4Q16363 1823 aa29.45■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 GRIN2DO15399 1336 aa29.45■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 GBF1Q92538 1859 aa29.44■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 DUSP28Q4G0W2 176 aa29.44■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 RNF207Q6ZRF8 634 aa29.44■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 WDR11Q9BZH6 1224 aa29.44■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 TRPV6Q9H1D0 765 aa29.44■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 IL23AQ9NPF7 189 aa29.44■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 UMODL1Q5DID0 1318 aa29.44■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa29.43■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 B4GALT4O60513 344 aa29.43■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 PCP11498 1178 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 PBX2P40425 430 aa29.43■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF543Q08ER8 600 aa29.43■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 TTC14Q96N46 770 aa29.43■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa29.43■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 PBX4Q9BYU1 374 aa29.43■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 CCL23P55773 120 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 RASIP1Q5U651 963 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 CLEC4DQ8WXI8 215 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 PNMA2Q9UL42 364 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 NEDD4P46934 1319 aa29.42■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 SDSP20132 328 aa29.41■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 PDE4DQ08499 809 aa29.41■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 ESR2Q92731 530 aa29.41■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa29.4■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 FGBP02675 491 aa29.4■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 MYL3P08590 195 aa29.4■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 OR6J1Q8NGC5 347 aa29.4■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 POLR3EQ9NVU0 708 aa29.4■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 MYH6P13533 1939 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF213O14771 459 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 GOLGA8HP0CJ92 632 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 CPT1AP50416 773 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 RPS6P62753 249 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 USH1GQ495M9 461 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 OTOP2Q7RTS6 562 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 HERVK_113Q902F9 699 aa29.39■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
PPP4R4-202ENST00000328839 MYO9BQ13459 2157 aa29.38■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 SNHG28P0DPA3 235 aa29.38■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 CHD1LQ86WJ1 897 aa29.38■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 SMC5Q8IY18 1101 aa29.38■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 MSRAQ9UJ68 235 aa29.38■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 WDR19Q8NEZ3 1342 aa29.38■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 AAMPQ13685 434 aa29.37■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 PPP2R5BQ15173 497 aa29.37■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 WNT8AQ9H1J5 351 aa29.37■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 CPVLQ9H3G5 476 aa29.37■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa29.37■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 PURAQ00577 322 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa29.36■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 SCLYQ96I15 445 aa29.36■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 UBA5Q9GZZ9 404 aa29.36■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 RAD50Q92878 1312 aa29.36■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 KDM4AO75164 1064 aa29.35■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 RAB30Q15771 203 aa29.35■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM47CQ5HY64 1035 aa29.35■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 IQCA1Q86XH1 822 aa29.35■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 DGKHQ86XP1 1220 aa29.35■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 PRDM12Q9H4Q4 367 aa29.35■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 B4DLN1 442 aa29.34■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 USP38Q8NB14 1042 aa29.34■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 PNMA1Q8ND90 353 aa29.34■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 DNERQ8NFT8 737 aa29.34■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 SCFD2Q8WU76 684 aa29.34■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 PPM1EQ8WY54 764 aa29.34■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 KAT14Q9H8E8 782 aa29.34■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 TNKSO95271 1327 aa29.34■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 SCN5AQ14524 2016 aa29.33■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa29.33■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 CYP2C9P11712 490 aa29.33■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 COPS5Q92905 334 aa29.33■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa29.33■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa29.33■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 VCANP13611 3396 aa29.33■■■□□ 2.29
PPP4R4-202ENST00000328839 ZBBXA8MT70 800 aa29.32■■■□□ 2.28
PPP4R4-202ENST00000328839 B4E1Z4 1266 aa29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87 ms