RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 PPP6R2O75170 966 aa18.51■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 FLOT1O75955 427 aa18.51■□□□□ 0.55
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CHTF18-202ENST00000317063 CUL5Q93034 780 aa18.5■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 PHIPQ8WWQ0 1821 aa18.5■□□□□ 0.55
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CHTF18-202ENST00000317063 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa18.5■□□□□ 0.55
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CHTF18-202ENST00000317063 TMEM60Q9H2L4 133 aa18.5■□□□□ 0.55
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CHTF18-202ENST00000317063 EDIL3O43854 480 aa18.49■□□□□ 0.55
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CHTF18-202ENST00000317063 PFKFB1P16118 471 aa18.49■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 IL17AQ16552 155 aa18.49■□□□□ 0.55
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CHTF18-202ENST00000317063 WDR18Q9BV38 432 aa18.49■□□□□ 0.55
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CHTF18-202ENST00000317063 A0A087WWV3 80 aa18.49■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 ESYT2A0FGR8 921 aa18.49■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 VWA3AA6NCI4 1184 aa18.49■□□□□ 0.55
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CHTF18-202ENST00000317063 MYH7BA7E2Y1 1941 aa18.49■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 hCG_1984214I3L0E3 225 aa18.48■□□□□ 0.55
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CHTF18-202ENST00000317063 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
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CHTF18-202ENST00000317063 EPSTI1Q96J88 318 aa18.48■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 NUP62CLQ9H1M0 184 aa18.48■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 AS3MTQ9HBK9 375 aa18.48■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 NMRK2Q9NPI5 230 aa18.48■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 WDR46O15213 610 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 SLFN14P0C7P3 912 aa18.48■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 CMA1P23946 247 aa18.48■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 KRT25Q7Z3Z0 450 aa18.48■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 PDILTQ8N807 584 aa18.48■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 HOMER2Q9NSB8 354 aa18.48■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 CSADQ9Y600 493 aa18.48■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 A0A1W2PQ27 194 aa18.48■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 A0A1W2PQ64 194 aa18.48■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 A0A1W2PQD8 194 aa18.48■□□□□ 0.55
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CHTF18-202ENST00000317063 TNMDQ9H2S6 317 aa18.48■□□□□ 0.55
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CHTF18-202ENST00000317063 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.48■□□□□ 0.55
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CHTF18-202ENST00000317063 CUTAO60888 179 aa18.47■□□□□ 0.55
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CHTF18-202ENST00000317063 CLK2P49760 499 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 FCHSD1Q86WN1 690 aa18.47■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 LDHDQ86WU2 507 aa18.47■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 C4orf32Q8N8J7 132 aa18.47■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 BANK1Q8NDB2 785 aa18.47■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 TDP2O95551 362 aa18.47■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 IREB2P48200 963 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 FAM160B2Q86V87 743 aa18.47■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 GINM1Q9NU53 330 aa18.47■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 IRF6O14896 467 aa18.46■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF202O95125 648 aa18.46■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 NF2P35240 595 aa18.46■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 NEK8Q86SG6 692 aa18.46■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 ATG4CQ96DT6 458 aa18.46■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF536O15090 1300 aa18.46■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 TRAPPC10P48553 1259 aa18.46■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 USP14P54578 494 aa18.46■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
CHTF18-202ENST00000317063 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CHTF18-202ENST00000317063 RESP18Q5W5W9 173 aa18.45■□□□□ 0.54
CHTF18-202ENST00000317063 CLSTN2Q9H4D0 955 aa18.45■□□□□ 0.54
CHTF18-202ENST00000317063 TREML2Q5T2D2 321 aa18.45■□□□□ 0.54
CHTF18-202ENST00000317063 PPP1R18Q6NYC8 613 aa18.45■□□□□ 0.54
CHTF18-202ENST00000317063 RNF214Q8ND24 703 aa18.45■□□□□ 0.54
CHTF18-202ENST00000317063 CCPG1Q9ULG6 757 aa18.45■□□□□ 0.54
CHTF18-202ENST00000317063 KINO60870 393 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CHTF18-202ENST00000317063 UBXN2AP68543 259 aa18.45■□□□□ 0.54
CHTF18-202ENST00000317063 LRSAM1Q6UWE0 723 aa18.45■□□□□ 0.54
CHTF18-202ENST00000317063 PCNTO95613 3336 aa18.45■□□□□ 0.54
CHTF18-202ENST00000317063 PP2D1A8MPX8 630 aa18.44■□□□□ 0.54
CHTF18-202ENST00000317063 SLC37A4O43826 429 aa18.44■□□□□ 0.54
CHTF18-202ENST00000317063 ALAS1P13196 640 aa18.44■□□□□ 0.54
CHTF18-202ENST00000317063 SYKP43405 635 aa18.44■□□□□ 0.54
CHTF18-202ENST00000317063 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
CHTF18-202ENST00000317063 POTEDQ86YR6 584 aa18.44■□□□□ 0.54
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