RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 PLCG1P19174 1290 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 TECP42680 631 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 KLRC3Q07444 240 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 BCS1LQ9Y276 419 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 TMEM232C9JQI7 657 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 RAD21O60216 631 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 GH2P01242 217 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 AMPD3Q01432 767 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 SPAG1Q07617 926 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 PDIA5Q14554 519 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 UBE2SQ16763 222 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 MYRIPQ8NFW9 859 aa20.8■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 TBC1D12O60347 775 aa20.79■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 RHOBTB3O94955 611 aa20.79■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 STX17P56962 302 aa20.79■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 NR1I3Q14994 352 aa20.79■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.79■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.79■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.79■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 STK17AQ9UEE5 414 aa20.79■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 SHTN1A0MZ66 631 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 WNT10BO00744 389 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 TDP2O95551 362 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 NDUFB10O96000 172 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 TXKP42681 527 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 PRELPP51888 382 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 AP3B2Q13367 1082 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 STIM1Q13586 685 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 VEZTQ9HBM0 779 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 SLC37A4O43826 429 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 EDIL3O43854 480 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 PPP1R2P41236 205 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 AMNQ9BXJ7 453 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.78■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 CCP110O43303 1012 aa20.77■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 KLRC4O43908 158 aa20.77■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 BMP3P12645 472 aa20.77■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 RASSF7Q02833 373 aa20.77■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.77■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.77■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.77■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.77■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 NELFBQ8WX92 580 aa20.77■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
HCLS1-201ENST00000314583 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 TNNT1P13805 278 aa20.77■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 MAP3K10Q02779 954 aa20.77■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.77■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.77■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 ADSSL1Q8N142 457 aa20.77■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.77■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 TMX1Q9H3N1 280 aa20.77■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 FZD9O00144 591 aa20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 USP11P51784 963 aa20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 TRAF1Q13077 416 aa20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 PLIN2Q99541 437 aa20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 A0A1W2PRG0 241 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 DYNC1I1O14576 645 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 SLC26A4O43511 780 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 PRCPP42785 496 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 FBXO11Q86XK2 927 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 TRIM9Q9C026 710 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 GDAQ9Y2T3 454 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 H7C1D1 291 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 KRT79Q5XKE5 535 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 NYAP1Q6ZVC0 841 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 LRRC15Q8TF66 581 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 ANO3Q9BYT9 981 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa20.75■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 PSMA7O14818 248 aa20.74■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.74■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 PTPN14Q15678 1187 aa20.74■□□□□ 0.91
HCLS1-201ENST00000314583 SV2BQ7L1I2 683 aa20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms