RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 METTL13Q8N6R0 699 aa26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 MAN1B1Q9UKM7 699 aa26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 PEX19P40855 299 aa26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO11Q86XK2 927 aa26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 MMS19Q96T76 1030 aa26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF11P52732 1056 aa26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 DIXDC1Q155Q3 683 aa26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 SPZ1Q9BXG8 430 aa26.35■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRD1A4D1F6 860 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM4Q9C037 500 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 UBE3CQ15386 1083 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 P2RX5Q93086 422 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 SART1O43290 800 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 RINT1Q6NUQ1 792 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 PLA2G4DQ86XP0 818 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1024Q9UPX6 916 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 EVI5O60447 810 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 PIK3CAP42336 1068 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 MFAP3P55082 362 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 RASIP1Q5U651 963 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 GSTA1P08263 222 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 GSTA2P09210 222 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKG1Q13976 671 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 RETREG2Q8NC44 543 aa26.34■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPN9O14815 690 aa26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 DLGAP5Q15398 846 aa26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 SORBS3O60504 671 aa26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 SAT1P21673 171 aa26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 LMNB2Q03252 620 aa26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 TTBK2Q6IQ55 1244 aa26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 SOWAHDA6NJG2 315 aa26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 M0R2C6 588 aa26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 RPSAP08865 295 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 ACRBPQ8NEB7 543 aa26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 MIS12Q9H081 205 aa26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHA4Q9UN74 947 aa26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 MYOM2P54296 1465 aa26.33■■□□□ 1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa26.33■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 INHBAP08476 426 aa26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAPPC10P48553 1259 aa26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 AOC3Q16853 763 aa26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 CDKL2Q92772 493 aa26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PCP11498 1178 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 JADE1Q6IE81 842 aa26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 MLXIPQ9HAP2 919 aa26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A087WWV3 80 aa26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 H7C0C1 242 aa26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ALAS1P13196 640 aa26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP5OP48047 213 aa26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 MMEL1Q495T6 779 aa26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 BTDP43251 543 aa26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PARD6BQ9BYG5 372 aa26.32■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 SGK1O00141 431 aa26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR46O15213 610 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 NME8Q8N427 588 aa26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCC2Q92887 1545 aa26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCC12Q96J65 1359 aa26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 MOCS3O95396 460 aa26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP4A11Q02928 519 aa26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 SMIM24O75264 130 aa26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF8O76064 485 aa26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 AFPP02771 609 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP21A2P08686 494 aa26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 NR2F2P24468 414 aa26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PTK2Q05397 1052 aa26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 RFX6Q8HWS3 928 aa26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 LRGUKQ96M69 825 aa26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 STMN1P16949 149 aa26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 ITKQ08881 620 aa26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 APOA5Q6Q788 366 aa26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 HACE1Q8IYU2 909 aa26.3■■□□□ 1.8
GNPTAB-201ENST00000299314 MGEA5O60502 916 aa26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms