RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF213O14771 459 aa23.04■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 CALML3P27482 149 aa23.04■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM240Q5SV17 173 aa23.04■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.04■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 GRIN2DO15399 1336 aa23.04■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.03■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 ACRP10323 421 aa23.03■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 DNAJB2P25686 324 aa23.03■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 CYP2C18P33260 490 aa23.03■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 DUSP28Q4G0W2 176 aa23.03■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.03■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.03■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 WDR19Q8NEZ3 1342 aa23.03■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.02■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 PSMC6P62333 389 aa23.02■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF365Q70YC5 407 aa23.02■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 DGKHQ86XP1 1220 aa23.02■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.02■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.02■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.02■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 LAMA4Q16363 1823 aa23.01■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 FOSL2P15408 326 aa23.01■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 RPS6P62753 249 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 TRPV6Q9H1D0 765 aa23.01■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 HIPK3Q9H422 1215 aa23.01■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 B4GALT4O60513 344 aa23■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 KDM4AO75164 1064 aa23■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 RASIP1Q5U651 963 aa23■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 IQCA1Q86XH1 822 aa23■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 UBA5Q9GZZ9 404 aa23■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 CPVLQ9H3G5 476 aa23■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 IL23AQ9NPF7 189 aa23■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 UMODL1Q5DID0 1318 aa23■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 HIP1O00291 1037 aa22.99■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 NT5C2P49902 561 aa22.99■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 PDE4DQ08499 809 aa22.99■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 GRIN2CQ14957 1233 aa22.99■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 USH1GQ495M9 461 aa22.99■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.99■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 PNMA1Q8ND90 353 aa22.99■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.99■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.98■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 B4E1Z4 1266 aa22.98■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 DNERQ8NFT8 737 aa22.98■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 TIFAQ96CG3 184 aa22.98■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.98■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF576Q9H609 170 aa22.98■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 KAT14Q9H8E8 782 aa22.98■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 MYL3P08590 195 aa22.97■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 EDNRBP24530 442 aa22.97■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 PBX2P40425 430 aa22.97■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 CPT1AP50416 773 aa22.97■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 CCL23P55773 120 aa22.97■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.97■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 PBX4Q9BYU1 374 aa22.97■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 FGBP02675 491 aa22.96■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 PPP2R5BQ15173 497 aa22.96■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 RGS22Q8NE09 1264 aa22.96■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 SCFD2Q8WU76 684 aa22.96■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 HERVK_113Q902F9 699 aa22.96■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 ANKS1AQ92625 1134 aa22.96■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.96■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.96■■□□□ 1.27
CXCL3-201ENST00000296026 A0A0C4DFX4 3053 aa22.95■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 B4DLN1 442 aa22.95■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.95■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.95■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 RAD50Q92878 1312 aa22.94■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.94■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D5Q92609 795 aa22.94■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 COPS5Q92905 334 aa22.94■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 KRT23Q9C075 422 aa22.94■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 TNKSO95271 1327 aa22.93■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 ABCB11O95342 1321 aa22.93■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.93■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CXCL3-201ENST00000296026 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.93■■□□□ 1.26
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