RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 BCAP29Q9UHQ4 241 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 H2AFZP0C0S5 128 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 SMTNP53814 917 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 HSPA2P54652 639 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 LRRC41Q15345 812 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 H2AFVQ71UI9 128 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 NEO1Q92859 1461 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 ZWINTO95229 277 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 LIFRP42702 1097 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 TRAPPC10P48553 1259 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 OGFOD1Q8N543 542 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 CFAP61Q8NHU2 1237 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 SNX16P57768 344 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 CYP2J2P51589 502 aa20.44■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 ICE2Q659A1 982 aa20.44■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.44■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.44■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 BACH1O14867 736 aa20.44■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.44■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 MAGEA9P43362 315 aa20.44■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 COG7P83436 770 aa20.44■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 IQCB1Q15051 598 aa20.44■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 TPH2Q8IWU9 490 aa20.44■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.44■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.44■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 PTPREP23469 700 aa20.44■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 GGA1Q9UJY5 639 aa20.44■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 SRGAP2O75044 1071 aa20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 MCTP2Q6DN12 878 aa20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 FTCDO95954 541 aa20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 VPS41P49754 854 aa20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 CTAGE3PQ8IX95 158 aa20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 GDAQ9Y2T3 454 aa20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 RETREG2Q8NC44 543 aa20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 ATG3Q9NT62 314 aa20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 PPP2R5AQ15172 486 aa20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 KSR1Q8IVT5 923 aa20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 CFBP00751 764 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 IFNB1P01574 187 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 ZBED6P86452 979 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 ADCY8P40145 1251 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 TRPC3Q13507 836 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 CCT6BQ92526 530 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.866e-9■■■□□ 18.9
PRKCI-201ENST00000295797 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 CCZ1BP86790 482 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 TCP10Q12799 353 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 DPF2Q92785 391 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 FOXN1O15353 648 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 THAP12O43422 761 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 GALNT17Q6IS24 598 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 KLHL29Q96CT2 875 aa20.42■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 PRR29P0C7W0 189 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 MCAMP43121 646 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 NNTQ13423 1086 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 PRR16Q569H4 304 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 LAMC1P11047 1609 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 TEX33O43247 280 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 WDR24Q96S15 920 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 PSTPIP2Q9H939 334 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 CHGBP05060 677 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC89Q8N998 374 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 H7C1W4 665 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 VCX3AQ9NNX9 186 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.41■□□□□ 0.86
PRKCI-201ENST00000295797 ANKRD7Q92527 254 aa20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms