RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277657.12

CCDC7-201, Transcript of coiled-coil domain containing 7, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC7, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7-201ENST00000277657 HS1BP3Q53T59 392 aa24.96■■□□□ 1.59
CCDC7-201ENST00000277657 ISM2Q6H9L7 571 aa24.96■■□□□ 1.59
CCDC7-201ENST00000277657 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CCDC7-201ENST00000277657 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.96■■□□□ 1.59
CCDC7-201ENST00000277657 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.96■■□□□ 1.59
CCDC7-201ENST00000277657 SMCHD1A6NHR9 2005 aa24.96■■□□□ 1.59
CCDC7-201ENST00000277657 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.96■■□□□ 1.59
CCDC7-201ENST00000277657 FOSP01100 380 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CCDC7-201ENST00000277657 UBA7P41226 1012 aa24.96■■□□□ 1.59
CCDC7-201ENST00000277657 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
CCDC7-201ENST00000277657 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CCDC7-201ENST00000277657 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.96■■□□□ 1.59
CCDC7-201ENST00000277657 WDR18Q9BV38 432 aa24.96■■□□□ 1.59
CCDC7-201ENST00000277657 SMC2O95347 1197 aa24.95■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 AFMP43652 599 aa24.95■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 PLCB2Q00722 1185 aa24.95■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 DPYDQ12882 1025 aa24.95■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 MORC3Q14149 939 aa24.95■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 WRNIP1Q96S55 665 aa24.95■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa24.94■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 CYP3A7P24462 503 aa24.94■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.94■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 MOXD1Q6UVY6 613 aa24.94■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 MBOAT7Q96N66 472 aa24.94■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 MTRQ99707 1265 aa24.94■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 TECP42680 631 aa24.94■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 NAALADL2Q58DX5 795 aa24.94■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 CCDC174Q6PII3 467 aa24.94■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 SARM1Q6SZW1 724 aa24.94■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 IKBKBO14920 756 aa24.93■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 STAT6P42226 847 aa24.93■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 TXKP42681 527 aa24.93■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 USP14P54578 494 aa24.93■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 KLRG1Q96E93 195 aa24.93■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.93■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 PTPRAP18433 802 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 SREBF1P36956 1147 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 MTMR2Q13614 643 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 PDIA5Q14554 519 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 CABP7Q86V35 215 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 HAS1Q92839 578 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 GSDMAQ96QA5 445 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 ARHGAP4P98171 946 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 NCAPHQ15003 741 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 MLKLQ8NB16 471 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 PICK1Q9NRD5 415 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.91■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.91■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 CUEDC2Q9H467 287 aa24.91■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24.91■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 ABCB11O95342 1321 aa24.9■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 SMTNL1A8MU46 457 aa24.9■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 VCAM1P19320 739 aa24.9■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 BACE1P56817 501 aa24.9■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 SPP2Q13103 211 aa24.9■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 LDHDQ86WU2 507 aa24.9■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.9■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 RAB34Q9BZG1 259 aa24.9■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 FZD1Q9UP38 647 aa24.9■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF536O15090 1300 aa24.9■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 ICAM1P05362 532 aa24.89■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 CASP1P29466 404 aa24.89■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF75DP51815 510 aa24.89■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 DGKZQ13574 1117 aa24.89■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.89■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.89■■□□□ 1.58
CCDC7-201ENST00000277657 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.89■■□□□ 1.57
CCDC7-201ENST00000277657 LRRC15Q8TF66 581 aa24.89■■□□□ 1.57
CCDC7-201ENST00000277657 STAMQ92783 540 aa24.89■■□□□ 1.57
CCDC7-201ENST00000277657 TRIM5Q9C035 493 aa24.89■■□□□ 1.57
CCDC7-201ENST00000277657 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
CCDC7-201ENST00000277657 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.89■■□□□ 1.57
CCDC7-201ENST00000277657 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.89■■□□□ 1.57
CCDC7-201ENST00000277657 PLCG1P19174 1290 aa24.88■■□□□ 1.57
CCDC7-201ENST00000277657 CIITAP33076 1130 aa24.88■■□□□ 1.57
CCDC7-201ENST00000277657 DACH1Q9UI36 760 aa24.88■■□□□ 1.57
CCDC7-201ENST00000277657 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CCDC7-201ENST00000277657 MYL1P05976 194 aa24.87■■□□□ 1.57
CCDC7-201ENST00000277657 CYP3A4P08684 503 aa24.87■■□□□ 1.57
CCDC7-201ENST00000277657 POLR2MP0CAP2 368 aa24.87■■□□□ 1.57
CCDC7-201ENST00000277657 CUL4BQ13620 913 aa24.87■■□□□ 1.57
CCDC7-201ENST00000277657 Q4G0T1 1027 aa24.87■■□□□ 1.57
CCDC7-201ENST00000277657 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms