RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253008.2

PRDM12-201, Transcript of PR/SET domain 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM12, Length 2,476 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12-201ENST00000253008 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.44■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.44■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 ZMYND10O75800 440 aa20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 TDP2O95551 362 aa20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 RHBDL3P58872 404 aa20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 GSTO1P78417 241 aa20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 GALNT17Q6IS24 598 aa20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 ZNF263O14978 683 aa20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 ZBTB22O15209 634 aa20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 ATP2B2Q01814 1243 aa20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 GRB10Q13322 594 aa20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 CNBD1Q8NA66 436 aa20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.42■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 POTEMA6NI47 508 aa20.42■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 MEA1Q16626 185 aa20.42■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 KIAA1328Q86T90 577 aa20.42■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.42■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 C6orf50Q9HD87 102 aa20.42■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.42■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.42■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.42■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 MYMKA6NI61 221 aa20.42■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 LAD1O00515 517 aa20.42■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.42■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.42■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.42■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.41■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 PSMD14O00487 310 aa20.41■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 PHACTR2O75167 634 aa20.41■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 PICALMQ13492 652 aa20.41■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.41■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 KCNK18Q7Z418 384 aa20.41■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.41■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa20.41■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 LRRC41Q15345 812 aa20.41■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 PNMA5Q96PV4 448 aa20.41■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 VPS18Q9P253 973 aa20.41■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 LDHCP07864 332 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 CASP8Q14790 479 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 SOGA3Q5TF21 947 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 HDXQ7Z353 690 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 AK8Q96MA6 479 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 F8W031 263 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 MYL1P05976 194 aa20.39■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 TUBB2AQ13885 445 aa20.39■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 ECM1Q16610 540 aa20.39■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.39■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.39■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 POLLQ9UGP5 575 aa20.39■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.39■□□□□ 0.86
PRDM12-201ENST00000253008 CCDC66A2RUB6 948 aa20.39■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 PDHBP11177 359 aa20.39■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 GNA11P29992 359 aa20.39■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 UBE2SQ16763 222 aa20.39■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.39■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 SAR1BQ9Y6B6 198 aa20.39■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 MTMR9Q96QG7 549 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 LMAN1P49257 510 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 ZBED6P86452 979 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 CALCRLQ16602 461 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 RGL2O15211 777 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 IDEP14735 1019 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 DRC1Q96MC2 740 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 CUEDC2Q9H467 287 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 MYH1P12882 1939 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 BICDL2A1A5D9 508 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 POTEB2H3BUK9 544 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 AKR1B1P15121 316 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 CALML4Q96GE6 196 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 MXD3Q9BW11 206 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM12-201ENST00000253008 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms