RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 HVCN1Q96D96 273 aa23.53■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 KIF11P52732 1056 aa23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 CFAP221Q4G0U5 840 aa23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 TTC38Q5R3I4 469 aa23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 MSL1Q68DK7 614 aa23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 MYO1EQ12965 1108 aa23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 FANCBQ8NB91 859 aa23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 RETREG2Q8NC44 543 aa23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 NSMCE1Q8WV22 266 aa23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 SPDL1Q96EA4 605 aa23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 KRT12Q99456 494 aa23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 MYH7P12883 1935 aa23.52■■□□□ 1.36
ODC1-201ENST00000234111 BUB1O43683 1085 aa23.51■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.51■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 C3orf20Q8ND61 904 aa23.51■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 ARMC2Q8NEN0 867 aa23.51■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 KIF9Q9HAQ2 790 aa23.51■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 BMP15O95972 392 aa23.51■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 MYZAPP0CAP1 466 aa23.51■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 PEX19P40855 299 aa23.51■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 CDK17Q00537 523 aa23.51■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.51■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 WHAMMQ8TF30 809 aa23.51■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 IL17AQ16552 155 aa23.5■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.5■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa23.5■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.5■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 CCT6BQ92526 530 aa23.5■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 HOOK2Q96ED9 719 aa23.5■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 PHF20Q9BVI0 1012 aa23.5■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 NAPBQ9H115 298 aa23.5■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 CUL5Q93034 780 aa23.5■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 MTMR8Q96EF0 704 aa23.5■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 LRP6O75581 1613 aa23.5■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 CLSTN1O94985 981 aa23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 PPP1R7Q15435 360 aa23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 RAPGEF5Q92565 580 aa23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 ATRNO75882 1429 aa23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 C5orf60A6NFR6 353 aa23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 TTI2Q6NXR4 508 aa23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.49■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 AKR1B10O60218 316 aa23.48■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 XBP1P17861 261 aa23.48■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 PKN1Q16512 942 aa23.48■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.48■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 TATDN2Q93075 761 aa23.48■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 DISP2A7MBM2 1401 aa23.48■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 PDE6AP16499 860 aa23.48■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 HSD17B3P37058 310 aa23.48■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 ODF2Q5BJF6 829 aa23.48■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.48■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.48■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 PSMA7O14818 248 aa23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 UBE3CQ15386 1083 aa23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 EBF2Q9HAK2 575 aa23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 ABCC12Q96J65 1359 aa23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 ERICH2A1L162 156 aa23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 PDE6BP35913 854 aa23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 MAGEA1P43355 309 aa23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 KRT23Q9C075 422 aa23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.47■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 EPHB6O15197 1021 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 CDC25CP30307 473 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-201ENST00000234111 STAT6P42226 847 aa23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms