RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 PPP4R3AQ6IN85 833 aa9.27□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 CNNM4Q6P4Q7 775 aa9.27□□□□□ -0.93
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VAMP3-201ENST00000054666 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.27□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.27□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 CCDC51Q96ER9 411 aa9.27□□□□□ -0.93
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VAMP3-201ENST00000054666 THAP9Q9H5L6 903 aa9.27□□□□□ -0.93
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VAMP3-201ENST00000054666 TAB2Q9NYJ8 693 aa9.27□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa9.27□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 SLC37A4O43826 429 aa9.27□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 KLRC4O43908 158 aa9.27□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 ENTPD3O75355 529 aa9.27□□□□□ -0.93
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VAMP3-201ENST00000054666 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.27□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 SV2BQ7L1I2 683 aa9.27□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 FAM114A1Q8IWE2 563 aa9.27□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 MKL1Q969V6 931 aa9.27□□□□□ -0.93
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VAMP3-201ENST00000054666 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 MTMR9Q96QG7 549 aa9.27□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.27□□□□□ -0.93
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VAMP3-201ENST00000054666 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa9.26□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.26□□□□□ -0.93
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VAMP3-201ENST00000054666 COBLO75128 1261 aa9.26□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 SLU7O95391 586 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
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VAMP3-201ENST00000054666 RBL2Q08999 1139 aa9.26□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 SEPT2Q15019 361 aa9.26□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.26□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.26□□□□□ -0.93
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VAMP3-201ENST00000054666 ERO1AQ96HE7 468 aa9.26□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 VPS16Q9H269 839 aa9.26□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 DNAI1Q9UI46 699 aa9.26□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa9.26□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 TRIM49BA6NDI0 452 aa9.25□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 POTEMA6NI47 508 aa9.25□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 GDF11O95390 407 aa9.25□□□□□ -0.93
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VAMP3-201ENST00000054666 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa9.25□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 CPLX3Q8WVH0 158 aa9.25□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 CSRNP1Q96S65 589 aa9.25□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
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VAMP3-201ENST00000054666 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.25□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa9.25□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 LRRC10BA6NIK2 292 aa9.25□□□□□ -0.93
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VAMP3-201ENST00000054666 CASP14P31944 242 aa9.25□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 GRB10Q13322 594 aa9.25□□□□□ -0.93
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VAMP3-201ENST00000054666 ANKRD7Q92527 254 aa9.25□□□□□ -0.93
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VAMP3-201ENST00000054666 GYPCP04921 128 aa9.24□□□□□ -0.93
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VAMP3-201ENST00000054666 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa9.24□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 UNC13DQ70J99 1090 aa9.24□□□□□ -0.93
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VAMP3-201ENST00000054666 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.24□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 RAD54LQ92698 747 aa9.24□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 GMCL1Q96IK5 515 aa9.24□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 ANO3Q9BYT9 981 aa9.24□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.24□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 L2HGDHQ9H9P8 463 aa9.24□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
VAMP3-201ENST00000054666 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.24□□□□□ -0.93
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