RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC6A-201ENST00000006275 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MYH4Q9Y623 1939 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF213O14771 459 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ORC4O43929 436 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZEB2O60315 1214 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TTLL1O95922 423 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FGRP09769 529 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KCNQ1P51787 676 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ACAD9Q9H845 621 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ASB14A6NK59 587 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 B4GALT4O60513 344 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GBF1Q92538 1859 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GRIN2DO15399 1336 aa22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PSMC6P62333 389 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MKL1Q969V6 931 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SCLYQ96I15 445 aa22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SMPD1P17405 629 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PTGS1P23219 599 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RNF146Q9NTX7 359 aa22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LAMA4Q16363 1823 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SGSM2O43147 1006 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FDX1P10109 184 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BMP3P12645 472 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLFN13Q68D06 897 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM232C9JQI7 657 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RFXAPO00287 272 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NMT2O60551 498 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CA3P07451 260 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TTLL4Q14679 1199 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STX8Q9UNK0 236 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PFKMP08237 780 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STAT2P52630 851 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 VWCEQ96DN2 955 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CERS4Q9HA82 394 aa22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ALAS1P13196 640 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PTH1RQ03431 593 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TKFCQ3LXA3 575 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ESR2Q92731 530 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 Q9Y3F1 56 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NEDD4P46934 1319 aa22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CYP2C9P11712 490 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM160B2Q86V87 743 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 COG5Q9UP83 839 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF536O15090 1300 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ACTN1P12814 892 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PIEZO1Q92508 2521 aa22.17■■□□□ 1.14
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