RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501		F5H6K3	240 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	BMP3	P12645	472 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	DPEP1	P16444	411 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	USP11	P51784	963 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	KLRC3	Q07444	240 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	NCAPH	Q15003	741 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	E2F4	Q16254	413 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	KRT79	Q5XKE5	535 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	TMC6	Q7Z403	805 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	FBXO11	Q86XK2	927 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	MTMR8	Q96EF0	704 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	MTFR1L	Q9H019	292 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	SIPA1L1	O43166	1804 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	PSMD14	O00487	310 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	PSMA7	O14818	248 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	RAD17	O75943	681 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	PRR29	P0C7W0	189 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	SKIL	P12757	684 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	STAT2	P52630	851 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	CACNB3	P54284	484 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	PAK1	Q13153	545 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	SEPT2	Q15019	361 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	USP49	Q70CQ1	688 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	KCTD1	Q719H9	257 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	SV2B	Q7L1I2	683 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	FAM160B2	Q86V87	743 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	ERMN	Q8TAM6	284 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	COA7	Q96BR5	231 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	EXOC1	Q9NV70	894 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	FANCL	Q9NW38	375 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	YDJC	A8MPS7	323 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	USP17L10	C9JJH3	530 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501		H7C1D1	291 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	TBX3	O15119	743 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	FOXN1	O15353	648 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	PLA2G6	O60733	806 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	KIF20A	O95235	890 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	GH2	P01242	217 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	ASNS	P08243	561 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	TXK	P42681	527 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	TRIM14	Q14142	442 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	VSTM4	Q8IW00	320 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	GML	Q99445	158 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	CPVL	Q9H3G5	476 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	DNAJC18	Q9H819	358 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	VEZT	Q9HBM0	779 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	TMX2	Q9Y320	296 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	TMEM232	C9JQI7	657 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PNKP-231	ENST00000640501	ZSCAN12	O43309	604 aa		9.34	□□□□□ -0.91

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