RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638107.1

5S_rRNA.28-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ELP1O95163 1332 aa6.99□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCDC171Q6TFL3 1326 aa6.99□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ARVCFO00192 962 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IGHDP01880 384 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ICAM1P05362 532 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PDHBP11177 359 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TNFAIP2Q03169 654 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GNASQ5JWF2 1037 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NSMFQ6X4W1 530 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SMC5Q8IY18 1101 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DCAF4Q8WV16 495 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TOX2Q96NM4 488 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SPC25Q9HBM1 224 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CYP39A1Q9NYL5 469 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TBX21Q9UL17 535 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZMYM6O95789 1325 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MROH7Q68CQ1 1323 aa6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CDH23Q9H251 3354 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ASB14A6NK59 587 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NFIBO00712 420 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TIMP1P01033 207 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SMPD1P17405 629 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SDSP20132 328 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NKX3-2P78367 333 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FPGSQ05932 587 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TLK2Q86UE8 772 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CHD1LQ86WJ1 897 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EXOC6Q8TAG9 804 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MYLIPQ8WY64 445 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GBF1Q92538 1859 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NEDD4P46934 1319 aa6.97□□□□□ -1.29
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CD4P01730 458 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GOLGA8HP0CJ92 632 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SNHG28P0DPA3 235 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CSF2RAP15509 400 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CALML3P27482 149 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PSMC6P62333 389 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NUCB1Q02818 461 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF543Q08ER8 600 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ITGA7Q13683 1181 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MFSD5Q6N075 450 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MFSD6Q6ZSS7 791 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MORC4Q8TE76 937 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TTC14Q96N46 770 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CPVLQ9H3G5 476 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GRIN2DO15399 1336 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EYSQ5T1H1 3165 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.95□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 B4E1Z4 1266 aa6.95□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF213O14771 459 aa6.95□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ACRP10323 421 aa6.95□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PCP11498 1178 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DNAJB2P25686 324 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms