RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 PBX4Q9BYU1 374 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO40Q9UH90 709 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF536O15090 1300 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC37A2A6NM11 1700 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC43A3Q8NBI5 491 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PRDM6Q9NQX0 595 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 TTLL1O95922 423 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGS1P23219 599 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.142e-7■□□□□ 8.5
CAPNS1-216ENST00000628306 GNASQ5JWF2 1037 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 NEDD1Q8NHV4 660 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SOWAHBA6NEL2 793 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ACRP10323 421 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SLFN13Q68D06 897 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 IFNL3Q8IZI9 196 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SGSM2O43147 1006 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 BMP3P12645 472 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 BEX3Q00994 111 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF365Q70YC5 407 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 IL27Q8NEV9 243 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 HOMER2Q9NSB8 354 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO9BQ13459 2157 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 XIRP2A4UGR9 3374 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-216ENST00000628306 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 GNAT2P19087 354 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TDO2P48775 406 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 AGBL1Q96MI9 1066 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 GRIN2DO15399 1336 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXP2O15409 715 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 LCTP09848 1927 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 SPC25Q9HBM1 224 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 UMODL1Q5DID0 1318 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD50Q92878 1312 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM232C9JQI7 657 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP2C18P33260 490 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TJAP1Q5JTD0 557 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 VTI1AQ96AJ9 217 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 VWCEQ96DN2 955 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ACAD9Q9H845 621 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 FDX1P10109 184 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRE1Q14246 886 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM63BQ5T3F8 832 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CXCL17Q6UXB2 119 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 RASGRP2Q7LDG7 609 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM199Q8N511 208 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 GMCL1Q96IK5 515 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF287Q9HBT7 754 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF146Q9NTX7 359 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFAIP2Q03169 654 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 HERVK_113Q902F9 699 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 IL17RAQ96F46 866 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 PRDM12Q9H4Q4 367 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 IL23AQ9NPF7 189 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 APPP05067 770 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 STAT2P52630 851 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TFAP4Q01664 338 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 STAG1Q8WVM7 1258 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 FSD1Q9BTV5 496 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 PDGFCQ9NRA1 345 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 GBF1Q92538 1859 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G6O60733 806 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPY3P0CV98 308 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPY8P0CW00 308 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 SMPD1P17405 629 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 MUM1L1Q5H9M0 696 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TAPT1Q6NXT6 567 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TLK2Q86UE8 772 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TRANK1O15050 2925 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 TLR3O15455 904 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
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CAPNS1-216ENST00000628306 AKNAD1Q5T1N1 836 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC174Q6PII3 467 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM160B2Q86V87 743 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CHMP4CQ96CF2 233 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 IL17RBQ9NRM6 502 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 MCCP23508 829 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SNAP25P60880 206 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 TRERF1Q96PN7 1200 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 WNT8AQ9H1J5 351 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 INCENPQ9NQS7 918 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-216ENST00000628306 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
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