RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 PICK1Q9NRD5 415 aa19.17■□□□□ 0.66
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CTAGE5O15320 804 aa19.16■□□□□ 0.66
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TRAPPC3-210ENST00000617904 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC3-210ENST00000617904 USP14P54578 494 aa19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF445P59923 1031 aa19.16■□□□□ 0.66
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TRAPPC3-210ENST00000617904 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
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TRAPPC3-210ENST00000617904 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYH4Q9Y623 1939 aa19.16■□□□□ 0.66
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TRAPPC3-210ENST00000617904 NDUFB10O96000 172 aa19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADCY7P51828 1080 aa19.15■□□□□ 0.66
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TRAPPC3-210ENST00000617904 KCTD1Q719H9 257 aa19.15■□□□□ 0.66
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC3-210ENST00000617904 SYDE2Q5VT97 1194 aa19.14■□□□□ 0.65
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TRAPPC3-210ENST00000617904 NUP62CLQ9H1M0 184 aa19.14■□□□□ 0.65
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TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM160A1Q05DH4 1040 aa19.12■□□□□ 0.65
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
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TRAPPC3-210ENST00000617904 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
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TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM63CQ9P1W3 806 aa19.12■□□□□ 0.65
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TRAPPC3-210ENST00000617904 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
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TRAPPC3-210ENST00000617904 OXER1Q8TDS5 423 aa19.11■□□□□ 0.65
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TRAPPC3-210ENST00000617904 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
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TRAPPC3-210ENST00000617904 MRE11P49959 708 aa19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGEF6Q15052 776 aa19.1■□□□□ 0.65
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TRAPPC3-210ENST00000617904 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP19.1■□□□□ 0.655e-6■■■□□ 14.7
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC3-210ENST00000617904 DACT1Q9NYF0 836 aa19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC3-210ENST00000617904 USP17L10C9JJH3 530 aa19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLURP2P0DP57 97 aa19.09■□□□□ 0.65
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