RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 ORC4O43929 436 aa29.49■■■□□ 2.31
PTPRF-216ENST00000617451 FGRP09769 529 aa29.49■■■□□ 2.31
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PTPRF-216ENST00000617451 ALX1Q15699 326 aa29.49■■■□□ 2.31
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PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD45Q5TZF3 282 aa29.49■■■□□ 2.31
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PTPRF-216ENST00000617451 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
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PTPRF-216ENST00000617451 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
PTPRF-216ENST00000617451 DUSP28Q4G0W2 176 aa29.36■■■□□ 2.29
PTPRF-216ENST00000617451 HERVK_113Q902F9 699 aa29.36■■■□□ 2.29
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